结论：针对您提出的“公司有房租收入但不还钱，是否可以申请直接收房租”的问题，这并非一个简单的“可以”或“不可以”的答案，而是需要根据具体情况来分析。以下是我从不同角度为您提供的详细解答。
一、法律关系分析
债权债务关系：
- 如果公司欠您的钱是基于某种债权债务关系（如借款、货款等），而公司同时有房租收入，这并不意味着您可以直接收取房租来抵债。债权债务关系具有相对性，即您只能向债务人（公司）主张权利，而不能直接向第三人（租户）主张。
代位权行使：
- 在特定情况下，如果公司怠于行使其对租户的到期债权，且该怠于行使债权的行为损害了您的利益，您可能可以根据《民法典》中关于债权人代位权的规定，向法院请求以自己的名义代位行使公司对租户的债权。但这一过程需要满足严格的法律条件，并经过法院的审查和判决。
二、实际操作建议
协商沟通：
- 首先，我建议您尝试与公司进行协商沟通，明确表达您的诉求和困境，看是否能够达成一个双方都能接受的还款协议。这通常是最快捷、最经济的解决方式。
发送律师函：
- 如果协商无果，您可以考虑委托律师向公司发送律师函，正式要求公司履行还款义务。律师函具有一定的法律威慑力，有时能够促使公司主动履行义务。
提起诉讼：
- 如果上述方式均无效，您可能需要考虑向法院提起诉讼，要求公司偿还债务。在诉讼过程中，您可以申请法院对公司的财产进行保全，包括房租收入等，以确保判决能够得到有效执行。但需要注意的是，即使您胜诉并申请了执行，如果公司确实没有可供执行的财产，您也可能面临执行难的问题。
申请破产清算（极端情况）：
- 如果公司已经资不抵债，无法清偿到期债务，且明显缺乏清偿能力，您可以考虑向法院申请公司破产清算。在破产清算过程中，公司的财产（包括房租收入）将被用于清偿债务。但这一过程复杂且耗时较长，且可能涉及众多债权人的利益分配问题。
三、风险提示
- 在采取任何行动之前，我建议您先咨询专业律师的意见，以确保您的行动符合法律规定并能够有效维护您的权益。
- 直接收取房租可能涉及非法侵占他人财产的风险，因此请务必谨慎行事。
四、后续行动建议
- 如果您决定采取法律行动，请尽快收集相关证据（如借款合同、转账记录、沟通记录等），并委托专业律师协助您处理相关事宜。
- 在整个过程中，请保持与律师的密切沟通，及时了解案件进展情况，并根据律师的建议调整策略。
如果您有任何进一步的疑问或需要更具体的法律建议，请随时向我咨询。