员工患甲流请病假，一般情况下是不应扣工资的。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，企业应当根据职工实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予一定的医疗期。在医疗期内，企业不得解除劳动合同，且应当按照规定支付病假工资或疾病救济费。
   • 病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。这意味着，即使员工因病请假，其工资也应得到一定程度的保障，而不是直接扣除。

2. 实际操作中的考虑：

   • 在实际操作中，企业通常会根据自身的规章制度和劳动合同来处理员工的病假工资问题。然而，这些规章制度和劳动合同必须符合国家法律法规的规定，不能侵犯员工的合法权益。
   • 如果企业的规章制度或劳动合同中明确规定了员工病假期间的工资支付标准，且该标准不低于国家法律法规规定的最低标准，那么企业可以按照该标准支付病假工资。
   • 如果企业的规章制度或劳动合同中没有明确规定，或者规定低于国家法律法规规定的最低标准，那么企业应当按照国家法律法规的规定支付病假工资。

3. 特殊情况下的处理：

   • 如果员工因甲流等传染病请假，且该传染病属于法定传染病范畴，企业可能还需要根据当地政府或卫生部门的特殊要求来处理员工的病假工资问题。例如，在某些地区或特定时期，政府可能要求企业对因法定传染病请假的员工给予全额工资支付或其他特殊待遇。
   • 另外，如果员工因病请假时间较长，且符合长期病假的条件，企业可能还需要按照相关规定为员工办理长期病假手续，并支付相应的病假工资或疾病救济费。

建议：

• 对于员工而言，如果因甲流等病因需要请假，应及时向企业提交病假申请和相关医疗证明，以便企业按照规定支付病假工资。
• 对于企业而言，应建立健全的规章制度和劳动合同条款，明确员工病假期间的工资支付标准和处理流程，以避免因处理不当而引发的劳动纠纷。

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