在处理盗窃案件中涉及的作案工具车辆时，我们主要依据《中华人民共和国刑法》的相关规定来进行。以下是对这一问题的详细解答：
一、处理原则
没收原则：
- 根据《刑法》第六十四条，违禁品和供犯罪所用的本人财物应当予以没收。因此，若车辆被明确认定为作案工具，且属于犯罪嫌疑人所有或明知他人用于犯罪而提供的，该车辆将被依法没收。
上缴国库：
- 没收的财物，包括作案工具车辆，将一律上缴国库，以确保国家财产的完整和法律的严肃性。
二、处理流程
扣押：
- 公安机关在立案后，会立即对涉嫌作案的车辆进行扣押，以防止其继续被用于犯罪活动。
调查取证：
- 公安机关会通过调查取证，确认车辆是否确实用于盗窃行为，以及车主的知情情况。这一步骤是判断车辆是否应被没收的关键。
没收处理：
- 若车辆被确认为作案工具，公安机关将依法移送至相关部门进行没收处理。
上缴或返还：
- 根据车辆的所有权和车主的知情情况，决定是将车辆上缴国库还是返还给车主。若车辆属于犯罪嫌疑人本人且用于犯罪，则上缴国库；若车辆属于他人且车主不知情，则案件审结后应归还车主；若车辆本身就是盗窃所得，则按赃物处理程序发还原所有人。
三、特殊情况处理
车辆属于犯罪嫌疑人本人：
- 若车辆明确被用于实施盗窃且起到关键作用，将被作为作案工具予以没收。
车辆属于他人（非犯罪嫌疑人）：
- 若车主明知车辆被用于盗窃仍提供，车辆同样被视为作案工具予以没收。
- 若车主对盗窃行为不知情，车辆是在正常借用等合法情形下被临时用于盗窃，案件审结后应归还车主。
盗窃所得车辆：
- 若车辆本身就是盗窃所得，将按照赃物的处理程序进行，通常会发还给合法的原所有人。
四、综合建议
- 对于车主而言，应增强法律意识，不得为犯罪分子提供便利，同时也要保护好自己的合法权益，避免无辜受损。例如，不要随意将车辆借给他人，特别是当对方行为可疑时。
- 对于社会公众而言，应了解相关法律知识，以便在遇到类似情况时能够做出正确的判断和应对。如果发现有人使用车辆进行盗窃等犯罪活动，应及时向公安机关报案。
综上所述，处理盗窃案件中涉及的作案工具车辆时，司法机关会综合考量案件的各种证据和实际情况，确保处理结果既符合法律规定，又体现公平正义原则。