事实劳动关系在事业单位是适用的，但具体适用情况需根据事业单位工作人员的聘用方式及身份性质来判断。以下从不同角度进行详细分析：

一、劳动法对事业单位的适用范围

根据《中华人民共和国劳动法》第二条及《中华人民共和国劳动合同法》第二条的规定，国家机关、事业组织、社会团体和与之建立劳动合同关系的劳动者，依照劳动法及劳动合同法执行。这意味着，对于事业单位中与单位建立劳动合同关系的劳动者，其事实劳动关系是受劳动法保护的。

二、事业单位工作人员的聘用方式及身份性质

1. 聘用合同制员工：

   • 对于实行聘用合同制的事业单位工作人员，其与单位之间的劳动关系在一定程度上可以参照劳动法的规定执行。这包括劳动合同的签订、履行、变更、解除和终止等方面。因此，如果事业单位工作人员是通过聘用合同与单位建立劳动关系的，那么其事实劳动关系是受劳动法保护的。

2. 非聘用合同制员工：

   • 对于未实行聘用合同制的事业单位工作人员，如通过任命、调任等方式进入事业单位的人员，其与单位之间的关系则主要受《事业单位人事管理条例》等法规的调整。这些法规对事业单位工作人员的招聘、录用、考核、培训、奖惩、工资福利等方面作出了详细规定，但与劳动法的具体规定存在差异。因此，对于这部分人员，其事实劳动关系可能不完全受劳动法保护，而是更多地受事业单位人事管理制度的约束。

三、事实劳动关系在事业单位中的具体表现

在事业单位中，事实劳动关系可能表现为工作人员实际为单位提供了劳动，但未签订书面劳动合同或签订的合同不符合劳动法的规定。在这种情况下，如果工作人员能够证明其与单位之间存在事实劳动关系（如通过工资支付记录、工作证、考勤记录等证据），那么其仍然可以依法享受劳动法规定的各项权益。

四、法律建议

1. 对于事业单位工作人员：

   • 如果您是事业单位的工作人员，且与单位之间存在事实劳动关系，建议您及时与单位签订书面劳动合同，以明确双方的权利和义务。
   • 如果单位未与您签订书面劳动合同或违反劳动法规定，您可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。

2. 对于事业单位：

   • 事业单位应当依法与工作人员签订书面劳动合同，明确双方的权利和义务。
   • 事业单位应当遵守劳动法的规定，保障工作人员的合法权益，避免产生劳动争议和纠纷。

总结来说，事实劳动关系在事业单位是适用的，但具体适用情况需根据事业单位工作人员的聘用方式及身份性质来判断。如果您在事业单位工作中遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。