在网购纠纷中，运费是否会计入违法所得，需根据具体违法行为的性质及法律规定来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 若违法行为涉及销售假冒伪劣商品或欺诈行为：

   • 在此类情况下，违法所得通常指的是因违法行为而获得的全部收入，包括商品的销售价款以及因销售而产生的其他收益，如运费。
   • 根据《中华人民共和国消费者权益保护法》及相关司法解释，经营者提供商品或者服务有欺诈行为的，应当按照消费者的要求增加赔偿其受到的损失，增加赔偿的金额为消费者购买商品的价款或者接受服务的费用的三倍；增加赔偿的金额不足五百元的，为五百元。这里的“购买商品的价款或者接受服务的费用”在网购中往往包括商品价格和运费。虽然该条款主要规定的是赔偿问题，但从中可以推断，运费作为交易的一部分，在违法行为中是被考虑在内的。
   • 若运费被认定为违法所得的一部分，那么在计算违法所得时，运费将被计入。

2. 若违法行为仅涉及合同违约或一般侵权行为：

   • 在合同违约或一般侵权行为中，违法所得的计算可能更侧重于直接因违约或侵权行为而获得的利益。
   • 运费在此类情况下可能不被直接视为违法所得，除非运费本身构成了违约或侵权行为的一部分（如故意收取高额运费而不提供相应服务）。
   • 若运费与违法行为无直接关联，或运费本身不构成违法所得的一部分，那么在计算违法所得时，运费通常不会被计入。

3. 特殊情况下的运费处理：

   • 在某些特殊情况下，如运费由第三方支付或运费已包含在商品价格中且未单独列出，运费的计入可能更为复杂。
   • 此时，需要根据具体交易情况、合同条款以及相关法律法规来综合判断运费是否应计入违法所得。

法律建议：

• 在处理网购纠纷时，若涉及违法所得的计算，建议首先明确违法行为的性质及法律规定。
• 收集并保留所有与交易相关的证据，包括商品价格、运费支付记录、合同条款等，以便在需要时提供证明。
• 若对运费是否应计入违法所得存在疑问，建议咨询专业律师或相关法律机构以获取准确解答。

可能法律后果：

• 若运费被错误地计入违法所得，可能导致违法者承担不必要的法律责任或经济损失。
• 若运费未被计入违法所得而应计入，则可能影响违法所得的准确计算，进而影响对违法者的处罚力度或赔偿金额。

综上所述，运费是否会计入违法所得需根据具体情况判断。在处理网购纠纷时，建议根据违法行为的性质、相关法律法规以及交易情况来综合判断运费的计入问题。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。