带货箱的电动三轮车被交警查到后的处理方式需根据车辆性质、当地法规及驾驶行为综合判断，常见情形如下：

1. 若车辆被认定为机动车（需驾驶证、牌照）

   • 无证驾驶：若驾驶人未取得摩托车驾驶证（D/E/F证），可能面临200-2000元罚款，并处15日以下拘留（《道路交通安全法》第99条）。
     
   • 无牌上路：若车辆未悬挂机动车号牌，可能被扣留车辆，并处200元罚款、记12分（《道路交通安全法》第95条）。
     
   • 准驾不符：若驾驶人持有C1等汽车驾照但未取得摩托车驾照，可能按“准驾不符”处罚，扣12分、罚款200-2000元，并可处15日以下拘留。
     

2. 若车辆被认定为非机动车（需符合国家标准）

   • 超标或违规改装：若货箱尺寸、电机功率等超过非机动车标准（如时速＞25km/h、整车质量＞55kg），可能被认定为“机动车属性”，按上述机动车处罚。
     
   • 违规载货：若货箱载货超过核定质量或尺寸（如遮挡视线、影响行驶安全），可能被警告或罚款20-200元（《道路交通安全法实施条例》第71条）。
     

3. 其他常见处罚情形

   • 未佩戴头盔：驾驶人或乘客未戴头盔，可能被罚款20-50元（部分地区扣分）。
     
   • 逆行、闯红灯：按普通交通违法处罚，罚款20-200元、记分（《道路交通安全法》第89、90条）。
     
   • 车辆被扣留：若车辆无合法手续（如发票、合格证），可能被强制报废或要求补办手续后放行。
     

建议行动：

• 立即核对车辆合格证、发票，确认是否属于机动车范畴；
  
• 若被处罚，可要求交警出具书面处罚决定书，并在规定期限内处理（如申诉、缴纳罚款）；
  
• 长期使用建议办理机动车牌照、驾驶证，避免重复违法。
  

提示：各地对电动三轮车的定性（机动车/非机动车）及处罚标准可能存在差异，具体以当地交管部门解释为准。如有疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律风险。