结论：法人配偶开个体户本身并不会直接导致被查，但是否会被查取决于多种因素，包括个体户的经营行为、税务合规情况以及是否涉及法人所在公司的利益等。以下从不同角度进行详细分析：
个体户的经营行为：
- 如果个体户的经营行为合法合规，没有涉及任何违法活动，如偷税漏税、制假售假等，那么其被查的可能性相对较低。
- 相反，如果个体户存在违法经营行为，如未按规定办理税务登记、未按时申报纳税、销售假冒伪劣产品等，那么其很可能成为税务、市场监管等部门的查处对象。
税务合规情况：
- 个体户作为市场主体，需要依法进行税务登记，并按时申报纳税。如果个体户能够严格遵守税法规定，按时足额缴纳税款，那么其税务合规性较高，被查的风险也相对较低。
- 如果个体户存在税务违规行为，如偷税漏税、虚开发票等，那么其不仅可能面临税务部门的处罚，还可能引发更广泛的调查，包括是否涉及法人所在公司的利益等。
是否涉及法人所在公司的利益：
- 如果法人配偶开的个体户与法人所在公司存在业务往来或利益关联，且这种往来或关联存在不合规之处，如利用个体户进行避税、转移资产等，那么个体户很可能成为相关部门调查的重点。
- 在这种情况下，个体户的经营行为不仅可能影响其自身的合规性，还可能对法人所在公司产生负面影响，甚至引发法律纠纷。
法律建议：
- 对于法人配偶开的个体户，建议其严格遵守相关法律法规，确保经营行为的合法合规性。
- 定期进行税务自查，确保税务申报的准确性和及时性，避免税务违规行为的发生。
- 如果个体户与法人所在公司存在业务往来或利益关联，建议明确双方的权利义务关系，确保交易的透明性和合规性。
可能的法律后果：
- 如果个体户存在违法经营行为或税务违规行为，可能面临罚款、没收违法所得、吊销营业执照等行政处罚。
- 在严重情况下，个体户的经营者还可能面临刑事责任追究，如因偷税漏税构成犯罪的，可能被依法追究刑事责任。
总之，法人配偶开个体户本身并不会直接导致被查，但需要确保经营行为的合法合规性，并关注税务合规情况以及是否涉及法人所在公司的利益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。