法人个人银行卡资金往来在特定情况下是会被查的。以下从不同角度对此问题进行分析：
税务稽查角度：
- 税务机关在依法进行税务检查时，有权对纳税人的资金往来情况进行核查，这包括法人个人的银行卡资金往来。如果法人个人的银行卡资金往来与公司的税务情况有关联，例如存在利用个人账户进行公司资金往来以逃避税务监管的情况，税务机关有权进行调查。
- 税务机关在调查过程中，可能会要求纳税人提供相关的银行流水记录、交易凭证等资料，以核实其资金往来的真实性和合法性。
法律诉讼角度：
- 在涉及公司法律纠纷的诉讼中，如果法人个人的银行卡资金往来与案件有关联，例如存在利用个人账户进行公司资金转移以逃避债务的情况，法院有权根据诉讼需要，要求相关方提供银行流水记录等证据材料。
- 在这种情况下，法人个人的银行卡资金往来记录可能成为法院判断案件事实、确定责任归属的重要依据。
反洗钱监管角度：
- 根据反洗钱法律法规的规定，金融机构有义务对客户的资金往来情况进行监测和报告，特别是对于大额交易和可疑交易。如果法人个人的银行卡资金往来存在异常或可疑情况，金融机构可能会向相关监管部门报告。
- 监管部门在接到报告后，有权对法人个人的银行卡资金往来进行进一步调查，以核实是否存在洗钱等违法行为。
法律建议：
- 作为公司法人，应严格遵守相关法律法规，确保个人银行卡资金往来的合法性和合规性。避免利用个人账户进行公司资金往来，以规避税务监管、逃避债务或进行其他违法行为。
- 如果公司存在资金往来需求，应通过公司账户进行，并确保相关交易的真实性和合法性。同时，应妥善保管好相关的银行流水记录、交易凭证等资料，以备税务机关、法院或监管部门进行核查。
可能后果：
- 如果法人个人的银行卡资金往来存在违法行为，如逃避税务监管、逃避债务或进行洗钱等，可能会面临法律制裁，包括罚款、没收违法所得、刑事处罚等。
- 此外，如果法人个人的银行卡资金往来与公司债务有关联，且被认定为恶意转移资产以逃避债务，还可能对公司债权人的利益造成损害，并引发相应的法律纠纷。
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