针对合伙做工程中出资不均（一个多付钱一个少付钱）的情况，工程款的支付和分配需结合出资比例、合伙协议约定、实际贡献等因素综合处理。以下是具体分析和建议：

1. 优先以书面合伙协议为准

若双方曾签订书面合伙协议，且协议中明确约定了出资比例、利润分配方式（如按出资比例分配、固定比例分配等），则工程款应按协议约定支付。

• 示例：若协议约定“甲出资70%，乙出资30%，利润按出资比例分配”，则工程款到账后，甲应分得70%，乙分得30%。
  
• 关键点：即使实际出资与协议约定不符（如甲实际多付、乙少付），若协议未约定“出资调整条款”，仍需按原协议执行；但若双方协商一致，可签订补充协议修改分配方式。

2. 无协议或协议未约定时，按实际出资比例分配

若未签订书面协议，或协议未明确利润分配方式，根据《民法典》第九百七十二条，合伙利润应按照实际出资比例分配。

• 操作步骤：
  
  1. 核算双方实际出资额（包括资金、设备、劳务等折价）；
     
  2. 计算各自出资占比（如甲实际出资80万元，乙出资20万元，则甲占80%，乙占20%）；
     
  3. 工程款到账后，按该比例分配。
     
• 例外：若一方能证明其对工程贡献远超出资比例（如负责施工管理、协调资源等），可主张调整分配比例，但需提供充分证据（如合同、工作记录、证人证言等）。

3. 一方多付钱、少付钱的处理方式

若一方实际出资多于约定比例，另一方少于约定比例，需区分情况处理：

• 情况1：双方同意调整出资比例
  若双方协商一致，可签订补充协议明确新的出资比例和利润分配方式，后续工程款按新协议执行。
  
• 情况2：一方未履行出资义务
  若少出资方未按约定履行出资义务，多出资方可要求其补足出资，或按实际出资比例分配利润；若因此导致工程损失，少出资方还需承担赔偿责任。
  
• 情况3：视为借款或赠与
  若多出资方明确表示超出部分为借款（如签订借条），则少出资方需返还；若为赠与，则无需返还，但利润分配仍按实际出资比例计算。

4. 工程款支付流程建议

为避免纠纷，建议按以下流程操作：

1. 设立共同账户：工程款统一汇入双方共管账户，避免单方挪用；
   
2. 预留必要费用：先扣除工程成本（如材料费、人工费、税费等），再分配利润；
   
3. 定期对账：每月或每季度核对出资和收支明细，双方签字确认；
   
4. 书面分配方案：每次分配工程款前，制定书面分配方案并双方签字，避免口头约定。

5. 风险提示

• 若未签订书面协议，一旦发生纠纷，举证难度大，可能按实际出资比例分配，导致预期落空；
  
• 若一方擅自分配工程款，可能构成违约，需赔偿另一方损失；
  
• 建议在工程启动前咨询律师，起草或审核合伙协议，明确权利义务。

总结：工程款的支付需以合伙协议为基础，无协议时按实际出资比例分配；若出资不均，可通过补充协议调整或按实际贡献协商；务必通过书面形式固定约定，并规范支付流程，以降低风险。如有具体协议或纠纷细节，可进一步向我咨询。