结论：村民之间转让宅基地签订的合同，若法院民事诉讼判决有效，这通常意味着合同在民事法律层面是合法且有效的。然而，这并不直接决定行政机关是否还有权进行行政处罚，因为行政处罚的依据是行政法律、法规，与民事合同的效力是两个独立的法律评价。以下是对此问题的详细分析：

一、民事合同有效性的判断

1. 合同内容合法性：宅基地转让合同的有效性首先取决于其内容是否合法。根据相关法律法规，宅基地的转让必须满足一系列条件，如转让方和受让方的资格、转让程序、用途限制等。若合同内容违反这些规定，即使法院判决合同有效，也可能存在法律上的瑕疵或风险。

2. 法院判决的效力：一旦法院对宅基地转让合同作出有效判决，该判决在民事法律层面具有约束力。这意味着合同双方必须履行判决所确定的义务，否则可能面临法律责任。

二、行政处罚的可能性

1. 行政处罚的依据：行政处罚是行政机关对违反行政法律、法规的行为所实施的制裁。因此，行政机关是否有权进行行政处罚，取决于宅基地转让行为是否违反了相关的行政法律、法规。

2. 行政处罚与民事合同效力的关系：民事合同的效力与行政处罚是两个独立的法律评价。即使宅基地转让合同在民事法律层面被认定为有效，如果转让行为违反了行政法律、法规（如未经批准擅自转让宅基地），行政机关仍有权依据相关法律法规进行行政处罚。

3. 行政处罚的具体情形：

   • 未经批准转让：如果宅基地转让未经相关部门批准，即使合同有效，行政机关也可能对转让方和受让方进行行政处罚，如罚款、没收违法所得等。
   • 违反用途限制：如果宅基地转让后，受让人擅自改变用途（如将宅基地用于商业开发），行政机关也有权进行行政处罚。

三、法律建议

1. 审查合同内容：在签订宅基地转让合同前，务必仔细审查合同内容，确保符合相关法律法规的规定，避免潜在的法律风险。

2. 办理相关手续：按照法律法规的要求，办理宅基地转让的相关手续，如经过村集体同意、向土地管理部门提出变更登记申请等。

3. 咨询专业律师：在涉及宅基地转让等复杂法律问题时，建议咨询专业律师，以获取准确的法律意见和帮助。作为畅治辉律师，我专注于行政诉讼、婚姻家庭、刑事辩护、行政复议、房产纠纷等领域，可以为你提供专业的法律咨询。

4. 关注行政处罚风险：即使宅基地转让合同在民事法律层面被认定为有效，也应关注行政处罚的风险。如果转让行为存在违法情形，应及时采取措施进行纠正，以避免行政处罚的发生。