结论：调解协议在申请司法确认时，若存在违反法律强制性规定、损害国家利益或他人合法权益、违背公序良俗、违反自愿原则、内容不明确、不属于人民法院受理范围或管辖、涉及特定身份关系或涉及其他特殊程序等情形，将无法得到司法确认。
违反法律强制性规定：
- 如果调解协议的内容违反了法律、行政法规的强制性规定，比如涉及违法犯罪活动、逃避纳税义务等，这样的协议因为违背了法律的基本准则，所以无法得到司法确认。例如，双方约定通过虚假诉讼来转移财产，这样的调解协议显然是非法的，不会被司法确认。
损害国家利益、社会公共利益或他人合法权益：
- 调解协议若对国家资源、公共安全、环境等造成损害，或者恶意串通损害国家利益，以及损害不特定多数人的合法权益，或者未经案外人同意处分其财产或权益，这些情形下的调解协议都不会得到司法确认。比如，双方约定通过调解来逃避对第三方的债务，这样的协议就损害了第三方的合法权益。
违背公序良俗：
- 公序良俗是社会普遍认可的道德规范和善良风俗。如果调解协议的内容违背了伦理道德、伤风败俗，比如以给付金钱为条件解除非法同居关系等，这样的协议将无法获得司法确认。因为司法确认需要维护社会的公序良俗，对于违背公序良俗的协议，司法机关是不会给予确认的。
违反自愿原则：
- 当事人在违背真实意思的情况下签订的调解协议，或者调解过程中存在强迫调解、显失公正，以及调解员与案件有利害关系未回避等情形，这些都会导致调解协议不被司法确认（当事人明知仍坚持申请的除外）。因为司法确认需要确保调解协议是双方自愿达成的，如果存在强迫或显失公正的情况，那么这样的协议就不是双方真实意思的表示，因此不会被司法确认。
内容不明确，无法确认和执行：
- 调解协议应当具备明确的权利义务内容，以便执行。如果协议内容模糊不清，各方对于具体权利义务关系、履行方式、履行期限等关键内容存在重大分歧，无法确定如何履行，那么司法机关将不予确认其效力。比如，双方约定“一方给予另一方一定的补偿”，但这样的约定过于模糊，无法确定具体的补偿金额和支付方式，因此这样的协议就不会得到司法确认。
不属于人民法院受理范围或管辖：
- 如果调解协议的内容不属于人民法院受理民事案件的范围，或者不属于收到申请的人民法院管辖，那么人民法院将裁定不予受理司法确认申请。比如，双方约定通过调解来解决行政争议，但这样的争议不属于人民法院受理民事案件的范围，因此这样的协议就不会得到司法确认。
涉及特定身份关系：
- 申请确认婚姻关系、亲子关系、收养关系等身份关系无效、有效或者解除的调解协议，不属于司法确认的范围，人民法院将不予受理。因为这些身份关系涉及到人身权利和家庭伦理，不能通过简单的调解协议来确认或解除。
涉及其他特殊程序：
- 涉及适用特别程序、公示催告程序、破产程序审理的调解协议，以及调解协议内容涉及物权、知识产权确权的，通常也不属于司法确认的范围。因为这些程序或确权事项有其特殊的法律规定和程序要求，不能通过简单的调解协议来确认或处理。
建议：为确保调解协议能够获得司法确认，当事人在签订协议时应严格遵守法律法规，确保协议内容合法、真实、明确，并在申请司法确认前仔细核对相关材料和受理范围。如果对于调解协议的内容或申请司法确认的程序存在疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况给出专业的法律建议。