结论：司机在不知情的情况下运输假烟，是否有机会被释放，主要取决于其是否能够证明自身对运输的货物为假烟并不知情，以及司法机关对案件的具体调查和认定。以下从不同角度进行分析：
一、法律角度
主观故意与过失：
- 在刑事法律中，构成犯罪通常需要具备主观故意或过失。如果司机能够证明自己确实不知情，即没有运输假烟的故意，且没有过失（如未尽到合理的注意义务），那么其可能不构成犯罪。
- 然而，如果司机在运输过程中应当发现货物异常（如包装、气味等），却未采取合理措施进行核实，可能被认定为存在过失，从而承担一定的法律责任。
证据收集与证明：
- 司机需要积极收集证据，证明自己对运输的货物为假烟并不知情。这可能包括与上家的沟通记录、运输合同、货物交接时的照片或视频等。
- 司法机关在调查过程中，也会综合考虑各种证据，包括司机的陈述、上家的供述（如果能够抓获）、货物的来源和去向等，以判断司机是否知情。
法律后果：
- 如果司机被证明不知情，且没有过失，那么其可能不会被追究刑事责任，从而有机会被释放。
- 如果司机被认定存在过失或故意，那么其可能面临刑事处罚，包括罚款、拘役或有期徒刑等。
二、实践角度
上家跑路的影响：
- 上家跑路确实给案件的调查带来了一定的困难。然而，这并不意味着司机就必然无法证明自己的清白。
- 司机可以积极配合司法机关的调查，提供所有可能的线索和证据，以协助司法机关尽快破案。
律师的协助：
- 在这种情况下，聘请一位经验丰富的刑事辩护律师是非常重要的。律师可以帮助司机分析案情，制定辩护策略，收集证据，并在法庭上为司机进行辩护。
- 律师还可以与司法机关进行沟通，争取为司机争取到最有利的处理结果。
三、建议与行动
保持冷静与配合：
- 司机应保持冷静，不要惊慌失措。同时，应积极配合司法机关的调查，如实陈述事实，提供所有可能的证据和线索。
及时聘请律师：
- 司机应尽快聘请一位经验丰富的刑事辩护律师，以便在案件调查和处理过程中得到专业的法律帮助和指导。
关注案件进展：
- 司机应密切关注案件的进展情况，及时与律师沟通，了解案件的最新动态和可能的结果。
总结来说，司机在不知情的情况下运输假烟，是否有机会被释放，取决于其是否能够证明自身对运输的货物为假烟并不知情，以及司法机关对案件的具体调查和认定。因此，司机应积极配合司法机关的调查，及时聘请律师，并密切关注案件的进展情况。如果你或你身边的人遇到类似情况，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。