结论：法院在简易程序转普通程序后未通知交费，但在判决书中要求补交诉讼费，这一做法在特定情况下是合规的，但具体是否合规还需结合案件具体情况和法院的操作流程来判断。以下从多个角度进行分析：
一、诉讼费缴纳的一般规定
根据《诉讼费用交纳办法》的相关规定，诉讼费用由原告预交，但最终由败诉方承担。在简易程序中，诉讼费的缴纳通常会在立案时或立案后的一定期限内由法院通知当事人缴纳。若案件由简易程序转为普通程序，诉讼费的缴纳标准和程序可能会发生变化，但法院仍需依法通知当事人。
二、简易程序转普通程序后的诉讼费缴纳
通知义务：
- 法院在将案件由简易程序转为普通程序时，应当依法通知当事人诉讼程序的变化以及可能涉及的诉讼费用变化。这包括诉讼费的缴纳标准、缴纳期限等。
- 如果法院未履行通知义务，导致当事人未及时缴纳诉讼费，这可能构成程序上的瑕疵。然而，这种瑕疵并不必然导致法院判决无效或需要重新审理，而是可能通过其他方式（如补交诉讼费）进行补救。
补交诉讼费的合法性：
- 如果法院在判决书中要求当事人补交诉讼费，这通常意味着法院认为当事人应当承担该部分费用，但之前由于某种原因（如未通知、当事人未及时了解等）未缴纳。
- 在这种情况下，补交诉讼费是合法的，因为诉讼费最终由败诉方承担是法律原则。法院有权在判决书中确定诉讼费的承担方和金额，并要求当事人履行缴纳义务。
三、可能存在的特殊情况
法院操作流程问题：
- 如果法院在简易程序转普通程序后确实未履行通知义务，且当事人能够证明这一点，那么当事人可以向法院提出异议或申请复议。
- 法院在审查后，如果认为异议或复议理由成立，可能会调整诉讼费的缴纳金额或期限，或者采取其他补救措施。
当事人自身原因：
- 如果当事人因自身原因（如未及时关注法院通知、未主动了解诉讼程序变化等）导致未缴纳诉讼费，那么法院在判决书中要求补交诉讼费也是合理的。
- 在这种情况下，当事人应当承担补交诉讼费的责任，并按照法院的要求履行缴纳义务。
四、建议与行动指南
核实法院通知情况：
- 当事人可以首先核实法院是否确实未履行通知义务，以及自己是否因某种原因未收到通知。
- 如果确实存在通知瑕疵，当事人可以向法院提出书面异议或申请复议，要求法院说明情况并采取补救措施。
积极履行缴纳义务：
- 如果法院在判决书中要求补交诉讼费，且当事人认为该要求合理合法，那么应当积极履行缴纳义务，避免因未缴纳诉讼费而影响判决的执行或面临其他法律后果。
咨询专业律师：
- 如果当事人对诉讼费的缴纳问题存在疑问或争议，可以咨询专业律师以获取更详细的法律建议和指导。
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