关于工程量有异议时是否存在诉讼时效问题，结论是肯定的，确实存在诉讼时效的限制，但具体适用情况需结合争议性质和法律规定来分析。以下从不同角度为你详细阐述：
一、诉讼时效的基本规定
根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。这意味着，在一般情况下，如果工程量存在异议，相关方应在知道或应当知道权利受到损害之日起三年内提起诉讼或仲裁，否则可能面临丧失胜诉权的风险。
二、不同争议性质下的诉讼时效适用
合同纠纷：
- 如果工程量异议是基于建设工程合同产生的，那么诉讼时效的适用将直接遵循民法典中关于合同纠纷的规定。即，从当事人知道或应当知道工程量存在异议之日起三年内提起诉讼或仲裁。
- 特殊情形：如果合同中约定了工程质量保证期或缺陷责任期，且在该期间内发现了工程量问题，那么诉讼时效可能从质量保证期或缺陷责任期届满之日起计算。但这一规定并非绝对，具体还需根据合同条款和实际情况来判断。
侵权纠纷：
- 如果工程量异议涉及到侵权行为（如因工程量计算错误导致一方财产损失），那么诉讼时效的适用将遵循民法典中关于侵权纠纷的规定。同样是从当事人知道或应当知道权利受到损害之日起三年内提起诉讼。
三、诉讼时效的中断与中止
- 诉讼时效中断：在诉讼时效期间内，如果因法定事由（如当事人一方提出要求、同意履行义务等）导致诉讼时效中断，那么从中断时起，诉讼时效期间将重新计算。
- 诉讼时效中止：在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因不可抗力或其他障碍不能行使请求权，诉讼时效将中止。从中止时效的原因消除之日起，诉讼时效期间继续计算。
四、实际建议
- 及时主张权利：一旦发现工程量存在异议，应尽快与对方协商解决或寻求法律途径维护自身权益，避免超过诉讼时效期间。
- 保留证据：在协商或诉讼过程中，务必保留好相关证据（如合同、工程量清单、验收报告等），以证明自己的主张。
- 咨询专业律师：虽然我已为你提供了基本的法律分析，但具体案件中仍可能涉及复杂的法律问题和事实认定。因此，在处理工程量异议时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。
最后需要强调的是，诉讼时效制度旨在督促权利人及时行使权利，维护社会交易秩序的稳定。因此，在处理工程量异议时，务必注意诉讼时效的限制，以免因超过时效而丧失胜诉权。如果你有任何进一步的疑问或需要法律帮助，请随时向我咨询。