结论前置：盖章传真过来的合同在符合相关法律规定的情况下是有效的，但需注意合同内容的合法性、真实性以及证据效力问题。
一、合同的有效性分析
法律依据：
- 根据《民法典》第四百六十九条的规定，当事人订立合同可以采用书面形式，其中包括传真等可以有形地表现所载内容的形式。因此，从法律层面来看，传真属于书面合同订立的一种有效形式，合同上盖章后即具有法律效力。
合同生效的必要条件：
- 行为人具有相应的民事行为能力：签订合同的双方当事人都应具备理解和承担合同权利义务的能力。例如，完全民事行为能力人可以独立签订合同；限制民事行为能力人签订的纯获利益或与其能力相适应的合同有效，其他则需法定代理人同意或追认。
- 意思表示真实：合同双方的意愿表达必须真实，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情况。若一方以不正当手段使对方违背真实意思签订合同，受损害方有权请求撤销。
- 不违反法律法规和公序良俗：合同内容必须合法合规，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得损害社会公共利益和违背公共道德。
二、传真合同的风险与应对措施
尽管传真合同在法律上具有效力，但在实际操作中仍面临一些风险，主要是传真件的真实性和完整性难以证明。为降低这些风险，建议采取以下措施：
妥善保存传真原件：
- 确保传真件清晰可辨，内容完整无缺，以便在需要时作为证据使用。
辅助确认方式：
- 在传真合同签订后，通过电话、电子邮件等方式进行再次确认，并保留好相关的沟通记录，以增强合同的证据效力。
优先使用原件：
- 条件允许的情况下，应尽快交换合同的纸质原件，以减少因传真件而产生的争议。
考虑公证或见证：
- 对于重要合同，可以考虑通过公证或见证的方式增强合同的法律效力和证据效力。
三、实际案例与注意事项
实际案例：
- 假设甲乙双方通过传真方式签订了一份买卖合同，并各自盖章确认。在合同履行过程中，若发生纠纷，传真件作为书面证据，在符合上述生效条件的情况下，应被法院认可。但若传真件存在模糊不清、盖章不真实等问题，则可能影响其证据效力。
注意事项：
- 在签订传真合同时，应特别注意合同条款的明确性和完整性，避免因条款不清而产生争议。
- 对于涉及重大利益或复杂法律关系的合同，建议咨询专业律师，以确保合同的合法性和有效性。
综上所述，盖章传真过来的合同在符合相关法律规定的情况下是有效的，但双方在签订时应特别注意合同内容的合法性和真实性，并采取必要的措施来确保合同的证据效力。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。