结论：询证函金额与实际存在质保金差异时，原则上不应直接盖“金额相符”章，需根据差异原因和性质分情况处理。以下是具体分析：

1. 若差异源于未到期的质保金

若询证函金额未扣除未到期质保金（例如合同约定质保期未满，部分款项需留存），此时盖章“金额相符”可能构成对事实的错误确认。

• 风险点：审计或交易对方可能依据“金额相符”章主张全部款项已无争议，后续质保金支付纠纷时，企业可能因自认行为陷入被动。
  
• 建议操作：在询证函“信息不符”栏注明差异原因（如“未到期质保金XX元未扣除”），并附合同条款或支付计划作为依据，避免盖章确认全部金额。

2. 若差异源于已到期但未支付的质保金

若质保金已到期但因纠纷或流程延迟未支付，此时盖章“金额相符”需谨慎：

• 风险点：可能被认定为对债务的承认，加速对方主张权利的期限（如诉讼时效中断），或影响企业抗辩权（如质量争议未解决）。
  
• 建议操作：若企业拟主张质量不合格等抗辩，应在询证函中明确标注“金额不符，因XX质量问题未解决，质保金XX元暂扣”，并留存质量检验报告等证据。

3. 若差异源于计算错误或笔误

若差异为单纯计算错误（如多记/少记质保金），需立即纠正并重新出具询证函：

• 风险点：盖章确认错误金额可能导致财务数据失真，影响审计结论或交易决策。
  
• 建议操作：联系对方说明情况，收回原函或出具补充说明，明确正确金额及差异原因，再行盖章确认。

4. 特殊情形：双方协商一致暂盖“相符”章

若企业与对方已就质保金支付达成书面协议（如延期支付、分期支付），且协议明确排除询证函对权利义务的影响，可考虑盖章，但需满足：

• 协议需经双方签字盖章，明确约定“询证函金额确认不影响质保金争议解决”；
  
• 企业内部留存协议副本，避免后续纠纷时举证不能。

总结：询证函的盖章行为具有法律意义上的确认效力，金额差异需结合差异原因、合同约定及企业抗辩权综合判断。建议企业在盖章前由财务与法务共同审核，必要时附书面说明或补充协议，避免因操作不当引发法律风险。如有具体案例或合同条款需进一步分析，可直接向我咨询。