关于借条上加盖公司财务专用章是否有效的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要综合考虑多个法律要点和实际情况。以下是我为您提供的详细分析：
一、财务章的作用与借条的法律效力
财务章作为企业在财务活动中使用的印章，它盖在借条上确实能增加借条的正式性和可信度，代表企业对借款事实的某种程度认可。然而，借条的法律效力并不完全取决于是否加盖了财务章。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，借条作为一种简单的借贷合同，其核心法律效力在于内容的真实性、合法性以及借款人的确认行为（如亲自签署或按指印）。
二、加盖财务章的有效情况
代表公司借款：如果借款行为是公司的真实意思表示，且用于公司经营、周转等正当事务，同时加盖财务章的行为遵循了公司内部规定的流程（如经过授权审批），那么该借条对公司具有法律约束力，公司需承担还款责任。
构成表见代理：即使加盖财务章的人员未获得公司明确授权，但如果出借人有合理理由相信其有代理权（如该人员为公司财务负责人或持有相关授权文件），并基于此与公司达成借款协议，那么该借条同样有效，公司需承担还款义务。
三、加盖财务章可能存在的争议或无效情况
私自盖章行为：如果公司内部人员未经授权私自加盖财务章用于个人借款，且出借人明知此情况，那么该借条对公司不发生效力，实际借款人应承担还款责任。
意思表示不真实：如果能证明加盖财务章的行为并非企业真实意思表示（如受欺诈、胁迫），那么借条的效力可能受影响，企业有权请求人民法院或仲裁机构撤销该借条。
违反法律法规：如果借款行为本身违法（如用于违法犯罪活动），即使加盖了财务章，借条也无效。
四、综合建议
核实信息：在借款前，出借人应仔细核实公司信息、借款用途及加盖财务章人员的代理权限等关键信息，以确保自身权益得到保障。
完善手续：对于公司而言，应加强内部控制和监管力度，规范财务章的使用流程，避免不必要的法律风险。
咨询专业律师：如有任何疑问或争议，建议咨询专业律师以获取更具体的法律指导和帮助。
综上所述，借条上加盖公司财务专用章的有效性并非绝对，而是需要综合考虑多个因素。在处理此类问题时，应重点关注借条内容的真实性、合法性以及借款人的确认行为，并咨询专业律师以获取更准确的法律意见。