结论：注销公司时存在其他应付款且债权人是法人的，处理方式需根据具体情况而定，主要有以下几种情况。

1. 若该应付款真实合法
   • 协商清偿：法人作为债权人，可以与公司协商确定一个合理的清偿方案。比如一次性全额清偿，如果公司资金不足以一次性支付，也可以协商分期支付。在协商过程中，要明确支付的时间节点、金额以及违约责任等内容，并形成书面协议，以保障双方的权益。例如，双方约定在公司注销前分三个月，每月支付一定比例的款项，若公司未按约定支付，需按照未支付金额的一定比例支付违约金。
   • 以资产抵偿：如果公司有一些闲置的资产，如设备、房产等，在双方协商一致的情况下，可以用这些资产来抵偿对法人的应付款。这需要对该资产进行评估，确定其价值与应付款金额是否相当。如果资产价值高于应付款，法人可能需要向公司支付差价；反之，公司需继续清偿剩余债务。例如，公司有一台价值50万元的设备，而欠法人的应付款为40万元，那么法人可以在取得设备后向公司支付10万元差价。
2. 若该应付款存在争议或不合理
   • 核实债务真实性：首先要对这笔其他应付款进行详细的核实，查看相关的合同、凭证等文件，确定该债务是否真实存在以及金额是否准确。如果发现存在虚假债务或者债务金额计算错误的情况，公司有权拒绝支付不合理的部分。例如，经过核实发现合同中约定的付款条件并未满足，那么公司可以以此为由拒绝支付相应的款项。
   • 通过法律途径解决：如果双方对于应付款的存在或金额无法达成一致意见，可以通过法律途径来解决纠纷。公司可以向法院提起诉讼，要求确认债务的真实性和金额；法人也可以作为原告向法院起诉，要求公司支付应付款。在诉讼过程中，双方需要提供相关的证据来支持自己的主张，由法院根据事实和法律作出判决。比如，法人提供了合同、发票等证据证明公司欠款，而公司提供了相反的证据证明债务不成立，法院将根据双方的证据进行综合判断。
3. 特殊情况处理
   • 公司破产清算：如果公司已经资不抵债，无法清偿到期债务，且明显缺乏清偿能力，那么可以依法向法院申请破产清算。在破产清算程序中，公司的资产将被变现，然后按照法定的顺序清偿债务。法人作为债权人，可以按照其债权比例获得相应的清偿。但需要注意的是，在这种情况下，法人可能无法全额获得应付款的清偿。例如，公司破产清算后，资产变现所得为100万元，而公司的总债务为200万元，法人对公司的债权为20万元，那么法人只能获得10万元的清偿。
   • 公司简易注销的特殊限制：如果公司选择简易注销程序，根据相关规定，公司在申请简易注销登记时，应当将债权债务清算完结。如果存在未清偿的其他应付款且债权人是法人的情况，一般不能直接进行简易注销。需要先按照上述方式处理完债务后，才能办理注销手续。否则，可能会面临注销登记被撤销等法律风险。

在处理注销公司时其他应付款是法人的这一问题时，情况较为复杂，建议你将具体情况详细告知我，以便我能为你提供更精准的法律建议。