关于新手实习期上高速发生事故保险是否会赔偿的问题，这确实是一个涉及交通法规和保险条款的复杂问题。下面我将从几个方面为您详细解答：
一、驾驶证实习期相关规定
根据《机动车驾驶证申领和使用规定》，机动车驾驶人在实习期内驾驶机动车上高速公路行驶时，应当由持相应或者更高准驾车型驾驶证三年以上的驾驶人陪同。这是为了保障新手驾驶员在高速上的行车安全，减少事故风险。若违反此规定，将面临20元至200元的罚款处罚。
二、保险赔偿的判定
交强险部分：
- 交强险是强制性的保险制度，其设立目的是为了保障道路交通事故受害人的合法权益。
- 无论驾驶人是否在实习期内，只要发生了交通事故且属于交强险的赔偿范围，保险公司都应在责任限额内进行赔偿。
- 但需要注意的是，保险公司在赔偿后有权向致害人（即肇事司机）进行追偿。
商业险部分：
- 商业车险的赔偿情况则需根据具体的保险合同条款来确定。
- 很多保险公司的商业险条款中会将“实习期内独自上高速”列为免责情形。这是因为实习期驾驶员单独上高速增加了事故风险，保险公司为了控制风险，可能会在合同中设置这样的免责条款。
- 如果保险合同中有这样的约定，并且保险公司已经向投保人明确说明了这一免责条款，那么在驾驶人实习期独自上高速出险时，保险公司可以依据合同条款拒绝商业险部分的理赔。
三、其他影响因素
除了是否独自上高速外，保险公司的赔偿还可能受到其他因素的影响，如驾驶人是否违章（如未贴实习标志）、事故的具体原因和责任划分等。如果驾驶人存在违章行为或事故责任不在保险赔偿范围内，保险公司也可能拒绝赔偿或仅部分赔偿。
四、建议与提醒
- 新手在实习期内驾驶机动车上高速公路时，应严格遵守相关规定，最好有持相应或更高准驾车型驾驶证三年以上的驾驶人陪同，以确保行车安全。
- 在购买车险时，应仔细阅读保险合同条款，特别是免责条款部分，以确保自己的权益得到充分保障。如果合同中有不明确或存在疑问的地方，应及时向保险公司咨询并确认。
- 驾驶时应遵守交通规则，确保行车安全，避免不必要的交通事故和损失。
综上所述，新手实习期上高速发生事故时，交强险部分通常会进行赔偿，但商业险部分则需根据具体的保险合同条款来确定。因此，在购买车险和驾驶过程中，都应谨慎对待，确保自己的权益得到充分保障。