结论：别人使用您的护理毕业证办理药店卖三类医疗器械以及使用您的护士执业证在诊所的行为，均可能对您产生不利影响，包括但不限于法律责任、职业声誉损害以及可能的行政处罚。
详细分析：
法律责任：
- 无证经营医疗器械：根据《医疗器械监督管理条例》第八十一条，未经许可从事第三类医疗器械经营活动的，将面临没收违法所得、违法生产经营的医疗器械和用于违法生产经营的工具、设备、原材料等物品，以及根据货值金额的罚款。如果您的护理毕业证被用于此类违法行为，您可能因被视为共犯或相关责任人而承担法律责任，即使您并未直接参与经营。
- 护士执业证滥用：护士执业证是您从事护理工作的合法凭证。如果您的护士执业证被用于诊所的非法活动，如超出执业范围或未经许可的执业行为，您同样可能面临法律责任，包括行政处罚和可能的刑事责任，具体取决于行为的严重性和后果。
职业声誉损害：
- 您的护理毕业证和护士执业证是您职业生涯的重要凭证。如果这些证件被用于非法活动，您的职业声誉将受到严重损害，可能影响您未来的就业机会和职业发展。
行政处罚：
- 如果相关部门发现您的证件被用于非法活动，您可能面临行政处罚，如警告、罚款、吊销执业证书等。这些处罚将直接影响您的职业生涯和法律地位。
建议：
- 立即采取行动：一旦发现您的证件被用于非法活动，应立即向相关部门报告，并配合调查。同时，您可以考虑采取法律措施保护自己的权益，如起诉侵权者或要求赔偿损失。
- 加强证件管理：确保您的护理毕业证和护士执业证等重要证件的安全，避免被他人盗用或滥用。您可以考虑将证件存放在安全的地方，并定期检查其使用情况。
- 咨询专业律师：如果您对如何处理此类问题感到困惑或不确定，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。作为专注于医疗纠纷、医疗损害、医疗事故赔偿、医疗事故鉴定领域的律师，我可以为您提供专业的法律咨询和帮助。
后续行动：
- 如果您已经发现或怀疑您的证件被用于非法活动，请立即收集相关证据，如聊天记录、转账记录、证件使用记录等，以便在需要时向相关部门提供证明。
- 保持与相关部门的沟通，及时了解案件进展和调查结果，以便采取进一步的法律行动。
总之，别人使用您的护理毕业证和护士执业证进行非法活动可能对您产生严重的不利影响。因此，您应立即采取行动保护自己的权益，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。