在第二次起诉离婚且男方缺席的情况下，法院的判决会基于一系列法律原则和程序进行，以下是对此问题的详细解析：
一、缺席判决的法律依据
根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，若被告经传票传唤无正当理由拒不到庭，或未经法庭许可中途退庭，法院有权进行缺席判决。在离婚诉讼中，这一原则同样适用。因此，若男方在第二次起诉离婚时缺席，且无正当理由，法院将依法进行缺席审理并作出判决。
二、第二次起诉离婚的特殊性
时间间隔要求：
- 第一次起诉离婚被驳回后，原告需等待6个月后才能再次起诉，这是《民法典》的明确规定。
- 第二次起诉时，由于双方已经历过一次诉讼，法院通常认为双方感情确已破裂的可能性较高，因此判决离婚的概率可能增加。
缺席判决的条件：
- 法院需通过合法方式（如邮寄传票、公告送达等）通知被告开庭时间和地点。
- 被告无正当理由拒不到庭或中途退庭，这是缺席判决的前提条件。
证据要求：
- 原告需提供充分证据证明夫妻感情确已破裂，如分居证明、家暴记录、出轨证据等。
- 若因客观原因无法自行收集证据，原告可申请法院调查取证。
三、缺席判决的具体流程
立案与送达：
- 原告向法院提交起诉状及相关证据，法院审查后立案。
- 法院通过直接送达、留置送达、邮寄送达或公告送达等方式向被告传递诉讼材料。
开庭审理：
- 若被告未到庭，法官会核实送达情况并记录在案。
- 原告陈述诉讼请求及事实理由，法官审查证据并进行调解（若可能）。
判决结果：
- 若调解无效且证据支持，法院将依法判决离婚，并对子女抚养权、财产分割等问题一并处理。
- 判决书通过公告或其他方式送达被告，自送达之日起生效。
四、判决结果的影响因素
证据充分性：
- 原告提供的证据是否充分、可信，将直接影响法院对夫妻感情是否确已破裂的判断。
男方缺席原因：
- 若男方因特殊情况（如在国外、身患重大疾病等）无法到庭，且提前向法院提交了书面意见，法院会综合考虑原告的诉求和男方的书面意见进行审理和判决。
- 若男方无正当理由拒不到庭，法院将主要依据原告提供的证据进行判决。
法律法规的遵循：
- 法院在作出判决时，必须遵循婚姻法等相关法律法规的规定，确保判决的合法性和公正性。
五、建议与注意事项
确保送达有效：
- 原告应提供被告准确的联系方式和住址，避免因送达问题导致判决效力争议。
准备充分证据：
- 原告应重点收集感情破裂的证据，如分居协议、聊天记录、报警记录等，以提高胜诉概率。
关注后续执行：
- 若判决涉及财产分割或抚养费支付，原告应在判决生效后及时申请执行，确保自身权益得到实现。
咨询专业律师：
- 复杂案件建议委托律师代理，确保程序合规并维护自身权益。律师可以提供专业的法律意见和诉讼策略，帮助原告更好地应对诉讼。
典型案例说明：
假设甲第一次起诉离婚被驳回后，6个月后再次起诉。法院通过公告送达传票给乙（男方），但乙未到庭。庭审中，甲提供了分居满两年的证据及乙长期赌博的记录。法院在核实送达情况后，认为甲提供的证据充分支持了“感情破裂”的主张，因此依法缺席判决离婚，并根据实际情况划分了共同财产。
综上所述，第二次起诉离婚且男方缺席时，法院将依据原告提供的证据、男方的缺席原因以及相关法律法规进行缺席判决。原告应确保送达有效、准备充分证据，并关注后续执行问题。如有需要，建议咨询专业律师以维护自身权益。