法官助理主持开庭一般是不合法的，但在特定情况下可能存在例外。以下从不同角度对此问题进行分析：

1. 法律规定角度：

   • 根据《中华人民共和国人民法院组织法》和《中华人民共和国法官法》的相关规定，法官是依法行使国家审判权的审判人员，包括院长、副院长、审判委员会委员、庭长、副庭长、审判员和助理审判员。法官助理并非法官序列中的一员，其职责主要是协助法官进行法律研究、起草法律文书以及其他与案件准备和案件管理有关的工作，并不包括主持开庭。
   • 开庭是审判活动的重要环节，应当由法官主持。法官助理主持开庭，缺乏法律依据，也不符合审判活动的组织原则。

2. 审判实践角度：

   • 在审判实践中，法官助理通常不会单独主持开庭。开庭需要法官对案件进行全面审查，听取双方当事人的陈述和辩论，并依法作出判决。法官助理由于缺乏审判权，无法独立承担这一职责。
   • 如果法官助理在法官的指导下或授权下参与开庭的某些环节，如记录、整理证据等，这是合法的。但这并不等同于法官助理主持开庭。

3. 例外情况：

   • 在某些特殊情况下，如法官因故不能出庭，且没有其他法官可以替代时，可能会由法院领导指定一名资深法官助理协助处理案件相关事宜。但这种情况下的“协助处理”并不等同于“主持开庭”，且需要严格遵循法院的内部规定和程序。
   • 另外，如果是在简易程序或小额诉讼程序中，且案件事实清楚、权利义务关系明确，法院可能会采用更为灵活的审判方式。但即便如此，开庭仍应由法官主持，法官助理的角色仍然是辅助性的。

法律建议：

• 如果您在参与诉讼过程中发现法官助理主持开庭的情况，可以向法院提出异议，要求由法官主持开庭。
• 如果您对法院的审判程序或审判人员的资质有疑问，可以向法院的监察部门或上级法院反映情况，寻求法律救济。

可能后果：

• 如果法官助理非法主持开庭，可能构成程序违法，影响案件的公正审判。当事人有权对此提出上诉或申请再审，以维护自己的合法权益。

总之，法官助理主持开庭一般是不合法的。在审判活动中，应当严格遵守法律规定和审判程序，确保案件的公正、高效审理。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。