针对您提出的“废水在线监测比对不合格是直接处罚还是整改”的问题，这并非一个简单的二选一决策，而是需要依据具体情况和相关法律法规来综合判断。

首先，我们要明确的是，废水在线监测系统的安装和使用，是为了更好地掌握企业污染物排放情况，及早发现、定位和处理污染源超标排放，预防和减少环境污染事故的发生。当在线监测数据与现场监测数据出现不一致时，我们需要依据相关法律法规和监测标准来确定哪个数据更具证据效力。

根据原环境保护部《关于污染源在线监测数据与现场监测数据不一致时证据适用问题的复函》以及新《生态环境行政处罚办法》的相关规定，若同一时段的现场监测数据与经过有效性审核的在线监测数据不一致，且现场监测数据符合法定的监测标准和监测方法的，那么应当以该现场监测数据作为优先证据使用。这意味着，在现场监测数据合法有效的情况下，如果其显示废水超标排放，那么企业将面临相应的法律责任。

对于法律责任的具体承担方式，根据《中华人民共和国水污染防治法》第八十三条第二项的规定，超过水污染物排放标准或者超过重点水污染物排放总量控制指标排放水污染物的，由县级以上人民政府环境保护主管部门责令改正或者责令限制生产、停产整治，并处十万元以上一百万元以下的罚款。这里的“责令改正”或“责令限制生产、停产整治”可以视为整改措施，而罚款则是处罚措施。因此，在废水在线监测比对不合格的情况下，企业既可能面临整改要求，也可能面临罚款处罚，或者两者兼有。

此外，如果企业未按照规定安装、使用、维护污染物排放自动监测设备，或者未保证监测设备正常运行，还可能依据《中华人民共和国大气污染防治法》《中华人民共和国水污染防治法》的相关规定，承担责令改正，处二万元以上二十万元以下的罚款；拒不改正的，依法责令停产整治的法律责任。

综上所述，废水在线监测比对不合格时，企业是否直接受到处罚还是需要整改，取决于现场监测数据的合法有效性以及企业的具体行为。如果现场监测数据合法有效且显示废水超标排放，企业将面临整改和处罚的双重责任。因此，我建议您企业应严格遵守相关法律法规和监测标准，确保废水在线监测系统的正常运行和数据的真实性、准确性，以避免不必要的法律风险。