针对您提出的“非住宅继承后再转让是否可以扣除以及相关文件规定”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、税收扣除方面
在非住宅继承后再转让的过程中，主要涉及的税费包括个人所得税、增值税、契税、印花税等。其中，关于扣除的问题，主要集中于个人所得税的计算上。
个人所得税：
- 若继承的非住宅房产再出售，且满足“满五唯一”条件（但需注意，非住宅通常不适用“唯一住房”的免税政策，此处“唯一”主要针对住宅，非住宅主要关注“满五”即房产证满五年），在计算个人所得税时，可以扣除房屋原值、转让过程中缴纳的税金以及合理费用。房屋原值通常为被继承人取得房屋时的价格，合理费用则需有合法凭证支持。
- 若不满足“满五”条件，个人所得税的计算公式为：（转让收入 - 房屋原值 - 转让过程中缴纳的税金 - 合理费用）× 20%。
增值税：
- 对于非住宅的增值税处理，通常与购买时间有关。若购买时间超过2年（含2年），在部分地区可能享受免征增值税的优惠（但具体政策因地区而异，特别是北上广深等一线城市可能有特殊规定）。
- 增值税的计算通常基于销售收入与购买住房价款之间的差额，并按照一定的征收率（如5%）进行缴纳。
契税与印花税：
- 契税在继承环节通常免征，但在转让环节可能需要根据当地政策缴纳。
- 印花税目前对个人销售或购买住房暂免征收，但非住宅的印花税政策可能有所不同，需根据当地规定确定。
二、相关文件规定
个人所得税：
- 主要依据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例，其中明确了财产转让所得应缴纳个人所得税，并规定了扣除项目和计算方法。
增值税：
- 依据《中华人民共和国增值税暂行条例》及相关实施细则，其中规定了增值税的征税范围、税率以及免税政策等。
契税与印花税：
- 契税主要依据《中华人民共和国契税法》及其实施细则。
- 印花税则依据《中华人民共和国印花税法》及相关规定。
三、操作建议
咨询当地税务部门：
- 由于税费政策可能因地区而异，且存在时间上的变化，因此建议在进行非住宅继承后再转让的操作前，先咨询当地税务部门，了解最新的税费政策和扣除规定。
准备相关凭证：
- 在计算个人所得税时，需要准备房屋原值、转让过程中缴纳的税金以及合理费用的合法凭证，以确保扣除项目的准确性和合法性。
遵循合法交易流程：
- 在完成继承过户后，进行非住宅的转让时，需遵循合法的房产交易流程，包括签订房屋买卖合同、申请房屋产权转移登记等步骤。
综上所述，非住宅继承后再转让在税收扣除方面主要涉及个人所得税的计算和扣除项目，同时需关注增值税、契税和印花税等相关政策。由于税费政策可能因地区而异，因此建议在进行相关操作前咨询当地税务部门，以确保信息的准确性和操作的合法性。