公安办理刑事案件程序违法一般不可直接提起行政诉讼，但可通过其他法律途径进行救济。具体分析如下：

1. 程序违法不可直接行政诉讼
   根据《行政诉讼法》第十二条，行政诉讼受案范围主要针对具体行政行为（如行政处罚、行政强制等）。公安机关在刑事立案后的侦查行为（如讯问、搜查、扣押等）属于刑事司法行为，不属于行政诉讼受案范围。因此，若仅因程序违法（如未出示搜查证、超期羁押等），当事人不能直接向法院提起行政诉讼。

2. 可通过刑事诉讼内部程序救济

   • 申请排除非法证据：根据《刑事诉讼法》第五十六条，若侦查人员通过刑讯逼供等非法方法收集证据，当事人可在庭审中申请排除非法证据，法院需调查核实后决定是否排除。
     
   • 申请立案监督：若公安机关应立案而不立案，当事人可向检察院申请立案监督（《刑事诉讼法》第一百一十三条），检察院有权要求公安机关说明理由或直接通知立案。
     
   • 申请取保候审或变更强制措施：若超期羁押或非法限制人身自由，当事人可依据《刑事诉讼法》第九十五条，向公安机关、检察院或法院申请取保候审或变更强制措施。

3. 国家赔偿与投诉举报

   • 国家赔偿：若程序违法导致当事人人身权或财产权受损（如错误拘留、错误逮捕），可依据《国家赔偿法》第十七条，在刑事诉讼程序终结后，向赔偿义务机关（公安机关或检察院）申请国家赔偿。
     
   • 投诉举报：可向公安机关的督察部门、上级公安机关或检察院投诉举报程序违法行为，相关部门需依法调查处理（《公安机关督察条例》《人民检察院刑事诉讼规则》）。

总结建议：若发现公安办理刑事案件程序违法，需根据具体情形选择救济途径：

• 涉及非法证据排除或强制措施变更的，优先在刑事诉讼中提出申请；
  
• 涉及应立案而不立案的，向检察院申请立案监督；
  
• 涉及人身或财产损害的，刑事程序终结后申请国家赔偿；
  
• 程序违法情节严重的，可同步向公安机关内部监督部门或检察院投诉。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件情况。