在交通肇事逃逸的情况下，保险公司是否可以进行代位赔偿，这确实是一个涉及交强险和商业险不同性质的问题，需要具体分析。
首先，关于交强险部分：
根据《机动车交通事故责任强制保险条例》的相关规定，交强险的设立目的是为了保障交通事故中受害人能及时获得基本的赔偿，分散社会风险。因此，即使驾驶人存在交通肇事逃逸的情形，保险公司也应当在交强险责任限额范围内对受害人进行赔偿。这包括受害人的医疗费用、财产损失等。不过，保险公司在赔偿后，有权向致害人（即肇事逃逸的驾驶人）进行追偿。
其次，关于商业险部分：
商业险的赔偿则通常依据保险合同的具体约定来确定。在大多数商业保险合同中，“交通肇事逃逸”会被列为免责事由。这意味着，当发生交通肇事逃逸时，保险公司可以依据合同约定，不承担商业险的赔偿责任。这部分的损失，通常需要由肇事司机自行承担。
然而，也存在一些特殊情况。如果保险公司在订立保险合同时，没有按照法律规定对该免责条款进行提示和明确说明，那么该免责条款可能不产生效力。在这种情况下，保险公司仍需在商业险范围内承担赔偿责任。但这种情况相对较少，且需要具体的法律程序和证据来支持。
综合建议：
对于受害人来说，在发生交通肇事逃逸后，应尽快报警并寻求法律援助。通过法律途径，可以确保自己的权益得到最大程度的保护，并了解具体的赔偿流程和程序。
对于肇事者来说，交通肇事逃逸是严重的违法行为，不仅可能导致保险赔偿的拒绝，还可能面临刑事责任的追究。因此，在发生交通事故后，应勇于承担责任，及时报警并救助伤者。
在购买保险产品时，无论是交强险还是商业险，都应仔细阅读合同条款，了解保险责任和免责范围。这样，在发生交通事故时，才能更好地维护自己的权益。
总之，交通肇事逃逸后保险公司的赔偿问题并不是一概而论的，而是需要根据具体情况以及所购买的保险合同来判断。希望以上分析能对您有所帮助。