若处罚决定已作出但分公司注销，可通过以下方式强制执行：

1. 执行总公司财产
   分公司虽不具备独立法人资格，但其民事责任由总公司承担（《公司法》第14条）。若分公司已注销，行政机关可直接以总公司为被执行人，查封、扣押、冻结总公司名下财产（如银行账户、不动产、股权等）。
   操作要点：需在执行程序中明确变更被执行人为总公司，并提供分公司与总公司的隶属关系证明（如工商登记信息、公司章程）。

2. 追加总公司为被执行人
   若处罚决定针对分公司作出后，分公司未履行义务即注销，可依据《最高人民法院关于民事执行中变更、追加当事人若干问题的规定》第15条，申请法院追加总公司为被执行人。
   关键证据：分公司注销证明、总公司承诺承担分公司债务的书面文件（如有）、行政处罚决定书。

3. 执行分公司未清算财产
   若分公司注销时未依法清算，可能存在隐匿财产或未分配剩余资产的情况。此时可：

   • 申请法院调查分公司注销时的清算报告、财务账册；
     
   • 若发现总公司存在抽逃资金、虚假清算等行为，可主张总公司承担连带责任（《公司法司法解释三》第12-14条）。
     风险提示：需证明总公司存在过错（如恶意注销、未通知债权人），否则可能面临举证困难。

4. 针对分公司负责人的追责
   若分公司负责人对注销行为存在过错（如故意逃避处罚），可依据《行政处罚法》第72条，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员处以罚款；若构成犯罪（如妨害公务罪），可移送公安机关追究刑事责任。
   适用情形：需有证据证明负责人存在主观恶意（如注销前未履行告知义务、转移财产）。

实务建议：

• 立即向法院申请财产保全，防止总公司转移资产；
  
• 同步向市场监管部门调取分公司注销时的清算报告、股东会决议等材料；
  
• 若总公司拒绝配合，可申请法院对其采取限制高消费、纳入失信名单等强制措施。
  

如有进一步证据或细节需要分析，可直接向我提供具体案情，我会结合《公司法》《行政强制法》及相关司法解释为您制定执行方案。