结论：姐姐追诉16年前的拆迁款是否有效，需结合诉讼时效、证据充分性、拆迁协议合法性及是否存在时效中断/中止情形综合判断，以下分情况说明：

1. 若拆迁协议明确约定姐姐为权利人，且未超过最长诉讼时效（20年）
   根据《民法典》第188条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为3年，但自权利受到损害之日起超过20年的，法院不予保护。若姐姐能证明拆迁协议中明确约定其享有拆迁款权益（如协议中有其签名、份额分配条款等），且从知道或应当知道权利被侵害之日起未超过3年（或自拆迁行为发生之日起未超过20年），则追诉有效。
   关键点：需提供拆迁协议原件、分配方案、沟通记录等证据，证明其权利存在及未放弃主张。

2. 若拆迁协议未明确姐姐权益，但存在家庭内部约定或口头协议
   若姐姐主张拆迁款基于家庭内部约定（如分家协议、口头承诺等），需证明该约定合法有效且未被撤销。根据《民法典》第469条，书面形式是合同成立的一般要求，但口头协议在满足“当事人具有民事行为能力、意思表示真实、不违反法律强制性规定”时亦有效。若姐姐能提供证人证言、录音录像、转账记录等辅助证据，且诉讼时效未届满，追诉可能被支持。
   风险点：口头协议举证难度大，法院可能因证据不足驳回诉求。

3. 若存在诉讼时效中断或中止情形
   根据《民法典》第194-195条，诉讼时效可因权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行、权利人提起诉讼或申请仲裁等情形中断（重新计算3年），或因不可抗力、无民事行为能力人无法主张权利等情形中止（暂停计算）。若姐姐能证明在16年间曾通过协商、投诉、诉讼等方式主张权利，或因特殊原因无法主张，则诉讼时效可能未届满。
   示例：姐姐曾向拆迁部门或家庭成员书面主张拆迁款，或因长期在外地、患病等原因无法行使权利。

4. 若拆迁行为本身违法或协议无效
   若拆迁行为未取得合法手续（如无拆迁许可证、未公告等），或拆迁协议存在欺诈、胁迫、显失公平等情形，姐姐可主张协议无效或撤销，并要求重新分配拆迁款。此时不受诉讼时效限制（《民法典》第152条），但需在知道或应当知道撤销事由之日起1年内行使撤销权。
   注意：需提供拆迁行为违法的证据（如行政处罚决定书、政府信息公开答复等）。

建议行动：

1. 立即收集拆迁协议、家庭内部约定、沟通记录、证人信息等证据；
   
2. 梳理16年间主张权利的证据（如书面材料、录音、证人证言）；
   
3. 咨询专业律师分析证据效力及诉讼策略，优先通过协商或调解解决；
   
4. 若协商无果，尽快向法院起诉，避免诉讼时效进一步消耗。
   

提示：拆迁款追诉涉及物权、合同、诉讼时效等多重法律关系，需结合具体证据和案情综合判断。如有进一步问题，可直接向我咨询。