合同签订双方盖章后，合同是可以修改的，且修改后若满足一定条件，仍然是有效的。以下是对此问题的详细分析：
一、合同修改后有效的情形
双方协商一致并盖章确认：
- 合同修改的核心在于双方当事人的意思表示一致。只要双方就修改内容达成共识，并在修改后的合同上盖章确认，该修改就是有效的。这体现了民法中的意思自治原则，即当事人有权根据自己的意愿设立、变更、终止民事法律关系。此时，只要修改内容不违反法律法规的强制性规定，不损害国家利益、社会公共利益及他人合法权益，修改后的合同即对双方具有法律约束力。
非重要内容的修改：
- 如果修改的内容并非合同的主要或关键条款，如一些格式条款的微调，且双方对此均无异议，并在修改处盖章确认，那么这种修改同样可能是有效的。这种情况下，虽然修改不是核心条款，但双方的认可使得修改具备了法律效力。
特别约定的遵守：
- 如果合同中原本就对修改及盖章有特别约定，如规定了特定的审批程序或盖章要求，只要双方按照这些约定进行了操作，修改后的合同也是有效的。这强调了合同中的约定优先原则。
二、合同修改后可能无效的情形
未经对方同意的擅自修改：
- 如果一方未经另一方同意擅自修改合同内容，并自行盖章，而对方并不知晓且未对修改内容进行追认，那么修改的部分对未同意的一方不发生法律效力。原合同中未修改的部分依然有效，双方应继续按照原合同履行义务。
重要内容修改未明确或存在争议：
- 如果修改的内容涉及合同的主要或关键条款，如合同标的、数量、质量、价款或报酬、履行期限、地点和方式等，且双方对修改内容存在争议或未明确约定，那么这种修改可能是无效的。在此情况下，可能需要通过法律途径来解决争议。
违反法律法规的强制性规定：
- 如果合同的修改违反了法律法规的强制性规定，或者违背了公序良俗，那么这种修改是无效的。即使双方都在修改处盖章确认，也不能改变其无效的性质。
三、操作建议与注意事项
明确修改内容并协商一致：
- 在进行合同修改时，双方应明确修改的具体内容，并确保修改内容符合法律法规和合同约定。任何修改都应经过双方协商一致，并以书面形式进行确认。
注意盖章位置与方式：
- 在修改处盖章是确认修改内容的重要方式之一。如果修改涉及重要条款或双方对修改内容存在争议，建议在修改处清晰加盖公司公章，并注明日期和双方签字确认。同时，要确保盖章的方式符合合同中的特别约定（如有）。
遵循法定或约定程序：
- 若法律、行政法规规定合同变更需要办理批准、登记等手续，则必须依照相关规定执行。例如，涉及重大国有资产交易、外商投资等合同的变更，可能需经过特定审批机关的批准。如果合同中已经约定了专门的变更程序，双方应严格按照该程序进行修改。
审查原合同条款：
- 在修改合同时，务必先仔细审查原合同的各项约定，确保没有违反任何不可变更的条款或法律规定。例如，原合同中可能存在明确规定的不得变更的条款，或合同性质本身不允许修改（如某些特定的行政合同）。
总结来说，合同签订双方盖章后是可以修改的，但修改必须满足双方协商一致、符合法律法规和合同约定等条件。在进行合同修改时，建议双方谨慎操作，确保修改后的合同具备法律效力并保障双方的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。