合同在修改的地方双方盖章，其效力主要取决于修改是否经过双方协商一致，以及修改内容是否符合相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细分析：

1. 双方协商一致并盖章确认有效：

   • 当合同双方当事人就修改内容达成一致意见，并且双方都在修改后的合同上盖章确认时，该修改是有效的。这体现了民法中的意思自治原则，即当事人有权根据自己的意愿设立、变更、终止民事法律关系。此时，只要修改内容不违反法律法规的强制性规定，不损害国家利益、社会公共利益及他人合法权益，修改后的合同即对双方具有法律约束力。
   • 举例：甲乙双方签订了一份买卖合同，后因市场价格变动，双方协商一致对价格条款进行了修改，并在修改处加盖了公司公章。这种情况下，修改后的价格条款是有效的。

2. 未经对方同意的擅自修改无效：

   • 如果一方未经另一方同意擅自修改合同内容，并自行盖章，而对方并不知晓且未对修改内容进行追认，那么修改的部分对未同意的一方不发生法律效力。原合同中未修改的部分依然有效，双方应继续按照原合同履行义务。
   • 举例：甲未经乙同意，擅自修改了合同中的交货地点，并在修改处加盖了公司公章。但乙对此并不知情，也未对修改内容进行追认。那么，修改后的交货地点条款对乙不发生法律效力，双方仍应按照原合同约定的交货地点履行义务。

3. 重要内容修改未明确或存在争议可能无效：

   • 如果修改的内容涉及合同的主要或关键条款，如标的、数量、质量、价款或者报酬、履行期限、履行地点和方式等，且双方对修改内容存在争议或未明确约定，那么这种修改可能是无效的。在此情况下，可能需要通过法律途径来解决争议。
   • 举例：甲乙双方对合同中的质量标准进行了修改，但修改后的标准表述模糊，双方对此存在争议。那么，这种修改可能是无效的，双方可能需要通过诉讼或仲裁等方式来确定质量标准。

4. 违反法律法规的强制性规定无效：

   • 如果合同的修改违反了法律法规的强制性规定，或者违背了公序良俗，那么这种修改是无效的。即使双方都在修改处盖章确认，也不能改变其无效的性质。
   • 举例：甲乙双方修改合同，将原本合法的交易内容变更为非法交易，并在修改处加盖了公司公章。那么，这种修改是无效的，因为违反了法律法规的强制性规定。

建议与注意事项：

• 在进行合同修改时，双方应明确修改的具体内容，并确保修改内容符合法律法规和合同约定。任何修改都应经过双方协商一致，并以书面形式进行确认。
• 在修改处盖章是确认修改内容的重要方式之一。如果修改涉及重要条款或双方对修改内容存在争议，建议在修改处清晰加盖公司公章，并注明日期和双方签字确认。
• 对于涉及重要条款或复杂情况的合同修改，建议提前向我咨询，以确保合同的合法性和有效性，并规避潜在的法律风险。

综上所述，合同在修改的地方双方盖章的效力取决于多种因素的综合考量。在进行合同修改时，务必谨慎操作并遵循相关法律法规和合同约定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。