结论：通常情况下，逾期两个小时，房东无权直接扣除合同里约定的两个月保证金，但具体还需结合租赁合同中的相关条款以及实际情况来判断。
分析如下：
合同条款的约定：
- 租赁合同是双方自愿达成的协议，其中的条款对双方均具有约束力。如果合同中明确规定了逾期支付租金的具体后果，包括是否扣除保证金以及扣除的金额或比例，那么应当按照合同约定执行。
- 若合同中仅笼统地规定了逾期支付租金需扣除保证金，但未明确扣除的具体条件、金额或比例，那么房东在扣除保证金时应当遵循公平、合理的原则，不能随意扣除大额保证金。
逾期时间的考量：
- 逾期两个小时相对于整个租赁期限来说，通常是一个较短的时间段。在一般情况下，这样的逾期时间可能不足以构成房东扣除保证金的充分理由。
- 除非合同中有特别约定，或者逾期行为给房东造成了实际损失，且该损失与扣除的保证金金额相当，否则房东扣除两个月保证金的行为可能显得过于严苛。
法律原则的适用：
- 根据《民法典》等相关法律法规，合同双方应当遵循公平、诚实信用的原则履行合同义务。房东在扣除保证金时，应当确保其行为符合这一原则。
- 如果房东扣除保证金的行为缺乏合理依据，或者扣除的金额明显过高，承租人有权要求房东返还多扣除的保证金，并可能通过法律途径维护自己的合法权益。
建议：
- 与房东协商：首先，建议承租人与房东进行友好协商，说明逾期支付的原因，并尝试达成一个双方都能接受的解决方案。
- 审查合同条款：如果协商无果，承租人应仔细审查租赁合同中的相关条款，了解自己的权利和义务，以及房东扣除保证金的条件和限制。
- 寻求法律帮助：如果房东的行为确实违反了合同约定或法律法规，承租人可以考虑寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果房东无正当理由扣除保证金，承租人可能面临经济损失，并可能需要通过法律途径来追回被扣除的保证金。
- 如果承租人能够证明房东的行为违反了合同约定或法律法规，那么房东可能需要承担相应的法律责任，包括返还多扣除的保证金、赔偿承租人的损失等。
总之，在处理此类纠纷时，建议承租人保持冷静、理性，通过合法途径来维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。