员工举报投诉公司的违法行为是合法且受法律保护的。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《劳动保障监察条例》第九条的规定，任何组织或者个人对违反劳动保障法律、法规或者规章的行为，都有权向劳动保障行政部门进行举报。同时，如果劳动者认为用人单位侵犯了其劳动保障合法权益，也有权向劳动保障行政部门投诉。此外，劳动保障行政部门还有义务为举报人保密，并对举报属实，为查处重大违反劳动保障法律、法规或者规章的行为提供主要线索和证据的举报人，给予奖励。

二、举报的意义

1. 维护市场公平与正义：员工举报公司的违法行为，有助于揭露和纠正企业的不法行为，从而维护劳动市场的公平竞争环境。
2. 保护权益：举报行为不仅保护了劳动者自身的合法权益，还间接保护了消费者和其他相关方的利益，因为公司的违法行为可能对消费者和其他相关方造成损害。
3. 促进企业规范：通过举报，可以推动企业自觉遵守法律法规，提高社会责任感和企业形象，从而促进企业的长期健康发展。

三、举报的后果

一旦公司的违法行为被查实，将面临一系列法律后果，包括但不限于：

1. 行政处罚：如罚款、整改等，这些处罚由劳动保障行政部门或其他相关监管部门依法执行。
2. 法律制裁：对于严重违法的企业，可能面临更严厉的法律制裁，包括但不限于吊销营业执照、刑事追责等。

四、举报的注意事项

为了确保举报的有效性和保护自身权益，员工在举报时应遵循以下几点：

1. 基于事实与证据：举报内容应真实可靠，并尽可能提供有效的证据支持，如文件、记录、照片等。这有助于劳动保障行政部门更快地查实违法行为，并采取相应的措施。
2. 通过正当途径：员工应通过合法的举报渠道进行举报，如劳动保障行政部门的举报电话、信箱、网上举报平台等。避免使用非法途径进行举报，以免给自己带来不必要的麻烦。
3. 保密性：劳动保障行政部门会严格为举报人保密，确保其个人信息安全。员工在举报时也应注意保护自己的隐私，避免泄露过多个人信息。
4. 避免滥用权利：举报是公民的权利，但应谨慎使用。频繁且无根据的举报可能会给相关部门和被举报单位带来不必要的困扰，也可能影响举报人的信誉。

五、实际案例与法律建议

在实际操作中，员工举报公司违法行为的案例并不少见。例如，某公司存在拖欠员工工资、未缴纳社会保险等违法行为，员工通过合法途径向劳动保障行政部门进行了举报。经过调查核实，劳动保障行政部门对该公司进行了罚款，并要求其补缴社会保险和支付拖欠的工资。这一案例充分说明了员工举报公司违法行为的合法性和有效性。

法律建议：如果你发现公司存在违法行为，不要害怕或犹豫，应勇敢地站出来进行举报。在举报前，请确保你掌握了足够的证据来支持你的举报内容。同时，选择合法的举报渠道进行举报，并保护好自己的个人信息和隐私。如果你在举报过程中遇到任何问题或困难，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助和支持。