被告人交代了犯罪过程，但对因果关系有异议，仍然有可能被认定为自首。具体分析如下：

在刑事案件中，自首的认定主要依据被告人是否主动投案，并如实供述自己的罪行。这里“如实供述自己的罪行”并不意味着被告人必须对所有案件细节都完全认可，而是指被告人对主要犯罪事实的供述是真实的，没有隐瞒或歪曲主要事实。

1. 如实供述主要犯罪事实：如果被告人交代了犯罪过程，这通常被视为如实供述了主要犯罪事实。即使被告人对因果关系有异议，但这并不影响其对主要犯罪事实的供述的真实性。

2. 对因果关系的异议：对因果关系的异议通常属于案件细节上的分歧，它可能涉及被告人对案件事实的理解、记忆或解释上的差异。这种异议并不足以否定被告人自首的成立，除非这种异议导致被告人否认了主要犯罪事实或隐瞒了重要情节。

3. 自首的认定：在认定自首时，法院会综合考虑被告人的投案情况、供述的主动性和真实性等因素。只要被告人主动投案，并如实供述了主要犯罪事实，即使对部分细节有异议，也仍然有可能被认定为自首。

综上所述，被告人交代了犯罪过程但对因果关系有异议，并不妨碍其自首的成立。当然，具体案件情况可能有所不同，法院会根据实际情况进行综合判断。如果你或你身边的人面临类似情况，建议尽早咨询专业律师，以便获得更准确的法律意见和帮助。