结论前置：在软件著作权申请中，单位与个人共同申请时，是否需要非职务证明取决于具体情况。以下分情况详细说明：

1. 职务作品与非职务作品的区分：

   • 职务作品：根据《著作权法》及相关规定，职务作品是指公民为完成法人或者其他组织工作任务所创作的作品。若软件是员工在单位工作期间，利用单位资源、按照单位要求或指示完成的，则该软件通常被视为职务作品。在这种情况下，单位作为著作权人或共同著作权人申请软件著作权时，无需个人提供非职务证明。
   • 非职务作品：若软件是个人在业余时间、利用个人资源、独立完成的，且与单位的工作任务无关，则该软件被视为非职务作品。当个人与单位共同申请软件著作权时，为了证明该软件并非职务作品，个人可能需要提供非职务证明，如创作时间、创作地点、创作过程、使用资源等方面的证据，以证明该软件的创作与单位无关。

2. 共同申请软件著作权的情形：

   • 合作开发：若单位与个人合作开发软件，且双方在合作协议中明确约定了著作权的归属和行使方式，则按照合作协议的约定执行。在这种情况下，通常不需要个人提供非职务证明，因为合作协议已经明确了双方的权益。
   • 委托开发：若单位委托个人开发软件，且双方在委托合同中明确约定了著作权的归属和行使方式，则按照委托合同的约定执行。同样，在这种情况下，个人通常也不需要提供非职务证明。
   • 无明确约定：若单位与个人共同开发软件，但双方未就著作权的归属和行使方式作出明确约定，且该软件可能涉及职务作品与非职务作品的争议时，个人可能需要提供非职务证明以维护自己的权益。

3. 实际操作建议：

   • 明确约定：为了避免潜在的纠纷和争议，建议单位与个人在合作开发软件前，就著作权的归属和行使方式作出明确约定，并签订书面合同。
   • 保留证据：个人在创作非职务作品时，应保留好创作时间、创作地点、创作过程、使用资源等方面的证据，以备不时之需。
   • 咨询专业律师：在涉及软件著作权申请、归属和行使等复杂问题时，建议咨询专业律师以获取更具体、更专业的法律意见。

法律背景：根据《著作权法》及相关规定，职务作品与非职务作品的区分对于确定著作权的归属和行使方式具有重要意义。在共同申请软件著作权时，明确作品的性质（职务作品或非职务作品）以及双方之间的约定（如有）是解决问题的关键。

可能后果：若单位与个人在共同申请软件著作权时未就著作权的归属和行使方式作出明确约定，且该软件涉及职务作品与非职务作品的争议时，可能导致双方之间的纠纷和诉讼。因此，建议双方在合作前就相关问题作出明确约定并签订书面合同。

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