核心结论：在客户公司已注销的情况下，追回已支付的款项需根据注销程序合法性、债务承接情况、交易真实性等关键因素，通过协商、诉讼或刑事报案等途径主张权利。以下是具体分析：

一、优先核查公司注销的合法性及债务承接主体

1. 若公司未经合法清算即注销
   根据《公司法》第183条及《公司法司法解释二》第11条，公司注销前需依法清算并通知债权人。若客户公司未履行清算义务（如未通知您申报债权、未公告等），您可主张清算组成员（股东、董事等）承担赔偿责任。
   操作建议：立即调取客户公司的工商注销档案，重点核查：

   • 清算报告是否记载已知债务；
     
   • 注销公告是否在省级以上报纸发布；
     
   • 清算组成员签字真实性。
     若存在程序瑕疵，可直接起诉清算组成员。

2. 若公司经合法清算后注销
   需进一步核查债务承接主体：

   • 股东承诺承接债务：若注销时股东签署《债务承接承诺书》，可直接起诉股东；
     
   • 公司合并/分立：根据《公司法》第174条，合并/分立后的公司需承担原债务，可起诉存续或新设公司；
     
   • 无承接主体：若公司无财产且无承接方，需通过刑事途径追责（见下文）。

二、通过民事诉讼主张权利

1. 起诉对象选择

   • 清算组成员：若注销程序违法，以股东、董事为被告；
     
   • 实际控制人：若公司被恶意注销（如虚构清算报告），可追加实际控制人为被告；
     
   • 交易相对方：若款项支付对象非客户公司（如关联公司收款），可同时起诉收款方。

2. 证据准备要点

   • 合同、付款凭证、发票等证明交易真实性；
     
   • 工商注销档案、清算报告等证明注销程序违法；
     
   • 沟通记录（如邮件、微信）证明对方未履行义务。

3. 诉讼时效
   自知道或应当知道权利受损之日起3年内起诉（如收到注销通知之日）。

三、刑事报案的适用情形

若客户公司存在以下行为，可向公安机关报案：

1. 虚构交易骗取款项：如伪造合同、冒用公章；
   
2. 恶意注销逃避债务：如注销前转移财产、虚构清算报告；
   
3. 涉嫌合同诈骗罪：根据《刑法》第224条，若对方以非法占有为目的，可能面临刑事处罚。
   注意：刑事报案需提供初步证据（如伪造文件、资金流向异常），公安机关立案后可同步推进民事诉讼。

四、实务风险提示

1. 财产保全优先：起诉前申请冻结股东财产，防止转移资产；
   
2. 执行难度：若公司无财产且股东已实缴出资，可能面临执行不能风险；
   
3. 跨境因素：若客户公司为外资或涉及境外主体，需考虑国际司法协助程序。

建议行动步骤：

1. 立即委托律师调取工商档案，分析注销合法性；
   
2. 根据证据情况，同步准备民事起诉材料及刑事报案文书；
   
3. 若对方有协商意愿，可要求签署《还款协议》并公证赋予强制执行力。
   

如有进一步证据或细节需要分析，可直接向我提供材料，我将为您制定具体方案。