检察院以事实不清、证据不足作出不起诉决定的，公安机关通常不会留下案底。以下是对这一问题的详细分析：
一、不起诉决定的性质与类型
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，不起诉决定主要分为三种类型：法定不起诉、酌定不起诉和证据不足不起诉。
法定不起诉：当犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者存在《刑事诉讼法》规定的特定情形（如情节显著轻微、危害不大等）时，人民检察院应当作出不起诉决定。这种情况下，犯罪嫌疑人从法律层面被认定不构成犯罪，因此不会留下案底。
酌定不起诉：当犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。虽然行为构成犯罪，但由于情节轻微等原因未被起诉，这同样不算有犯罪记录，不会留下案底。
证据不足不起诉：对于二次补充侦查后证据仍不足的案件，人民检察院应当作出不起诉决定。这是基于证据情况作出的决定，并不等同于认定犯罪嫌疑人有罪，因此同样不会留下案底。
二、“案底”的定义与影响
“案底”通常指的是一个人曾经犯过罪并被记录在案的犯罪记录。在我国，只有经过人民法院依法审判并定罪的人才会有犯罪记录，即“案底”。由于不起诉决定意味着犯罪嫌疑人没有被法院定罪，因此不会形成犯罪记录，也就不会有“案底”。
三、不起诉决定的法律后果
无犯罪记录：被不起诉人不会因为这次事件而留下犯罪记录，对其未来的就业、升学等通常不会产生负面影响。
可能的后续处理：虽然被不起诉人不会被追究刑事责任，但如果其行为违反了治安管理处罚法等其他法律法规，仍可能面临行政处罚或民事赔偿等后果。例如，如果被不起诉人的行为构成了治安管理处罚法中的违法行为，公安机关可能会对其进行行政处罚，如罚款、拘留等。但这些处罚并不等同于犯罪记录，不会留下案底。
四、特殊情况下的考虑
在极少数特殊情况下，如当事人之前已被公安机关采取强制措施（如拘留、逮捕等），且这一信息被记录在个人档案中，那么在某些特定环节（如政审等）下，这可能被视为一种“不利记录”。但这种“记录”与通常所说的犯罪记录是有区别的，它并不等同于案底，也不会对个人产生长期的负面影响。
五、建议与咨询
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