挂靠资质的实际施工人应首先向合同相对方（即被挂靠企业或转包人、违法分包人）主张工程款，在特定条件下，也可以向发包人主张权利。以下是对此问题的详细分析：
一、向合同相对方主张权利
法律依据与合同关系：
- 挂靠的实际施工人通常与被挂靠企业或转包人、违法分包人之间存在直接的合同关系（尽管挂靠协议可能因违法而无效，但实际施工的事实存在）。根据合同相对性原则，实际施工人应首先向合同相对方主张工程款。
操作方式：
- 协商：实际施工人可以与被挂靠企业或转包人、违法分包人就工程款的支付金额、支付时间等问题进行沟通和谈判，争取达成一致意见，以友好解决纠纷。
- 诉讼：如果协商无果，实际施工人可以向人民法院提起诉讼，要求合同相对方支付工程款。在诉讼过程中，需要提供充分的证据来证明自己的权利主张，如施工合同、结算单、付款凭证等。
证据要求：
- 实际施工人应收集并保留能够证明自己实际施工情况和工程款约定的相关证据，这是主张权利的关键。
二、向发包人主张权利
法律依据与突破合同相对性：
- 在特定情况下，实际施工人可以突破合同相对性，向发包人主张权利。这主要基于《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》中关于实际施工人权益保护的规定。
适用条件：
- 发包人存在欠付转包人或违法分包人建设工程价款的行为。
- 实际施工人能够证明发包人在签订合同时明知或应知挂靠关系的存在。这通常需要实际施工人提供充分的证据来证明，如发包人与被挂靠企业之间的往来函件、会议纪要等。
操作方式：
- 实际施工人可以直接以发包人为被告向人民法院提起诉讼。人民法院可能会追加转包人或违法分包人为共同被告或第三人，以便查清案件事实并明确各方责任。
三、注意事项与法律风险
证据收集：
- 无论选择哪种方式追讨工程款，实际施工人都需要充分收集并保留相关证据，以确保自己的权利主张得到支持。证据是诉讼的基石，没有充分的证据，权利主张可能难以得到法院的支持。
诉讼时效：
- 根据《民法典》的相关规定，实际施工人应当在知道或应当知道权利受到侵害之日起的法定诉讼时效期间内提起诉讼，否则可能会丧失胜诉权。因此，及时行使权利至关重要，避免因为超过诉讼时效而无法追讨工程款。
法律风险：
- 挂靠行为本身存在一定的法律风险，如合同无效、行政处罚等。实际施工人在追讨工程款时，应充分了解并评估这些风险，并采取相应的防范措施。例如，可以咨询专业律师，了解相关法律法规和司法实践，以便更好地维护自己的合法权益。
四、实际操作建议
优先协商：
- 在追讨工程款时，实际施工人应优先尝试与合同相对方或发包人进行协商，以友好解决纠纷。协商可以节省时间和成本，避免不必要的法律诉讼。
及时诉讼：
- 如果协商无果，实际施工人应及时向人民法院提起诉讼，以免超过诉讼时效。在诉讼过程中，要积极配合法院的工作，提供充分的证据来支持自己的权利主张。
寻求专业帮助：
- 在追讨工程款的过程中，实际施工人可能会遇到各种法律问题和困难。此时，可以寻求专业律师的帮助，以便更好地维护自己的合法权益。作为专业律师，我可以为你提供全面的法律咨询和诉讼代理服务。
综上所述，挂靠资质的实际施工人在追讨工程款时，应首先向合同相对方主张权利，并在满足特定条件时向发包人主张权利。同时，他们需要注意证据收集、诉讼时效以及法律风险等问题，以确保自己的合法权益得到有效保护。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。