结论：当员工因重大过错造成用人单位损失时，用人单位确实可以主张赔偿，但不一定必须通过提起民事诉讼的方式，还可以通过协商、劳动仲裁等途径解决。以下是对此问题的详细分析：
一、主张赔偿的法律依据
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。在劳动关系中，如果员工因重大过错（如故意或重大过失）导致用人单位遭受损失，用人单位有权要求员工承担相应的赔偿责任。这种赔偿责任可能包括直接经济损失和间接经济损失，具体范围需根据实际情况和法律规定来确定。
二、主张赔偿的途径
协商：
- 用人单位可以首先尝试与员工进行协商，就赔偿事宜达成一致意见。这种方式成本较低，且有助于维护双方的关系。
劳动仲裁：
- 如果协商不成，用人单位可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。劳动仲裁是一种相对快速、简便的解决劳动争议的方式，其裁决具有法律效力。
- 在申请劳动仲裁时，用人单位需要提交相关证据，如员工过错造成的损失证明、员工过错行为的证据等，以支持其赔偿请求。
民事诉讼：
- 如果劳动仲裁未能解决争议，或者用人单位对劳动仲裁结果不满意，还可以向人民法院提起民事诉讼。
- 民事诉讼程序相对复杂，成本较高，但具有更强的法律效力和执行力。在诉讼过程中，用人单位需要提供充分的证据来证明员工的过错行为以及由此造成的损失。
三、注意事项
证据收集：
- 无论选择哪种途径主张赔偿，用人单位都需要收集充分的证据来支持其请求。这包括员工过错行为的证据、损失大小的证据等。
赔偿范围：
- 赔偿范围应根据实际情况和法律规定来确定。一般来说，赔偿范围应限于员工过错行为直接造成的损失，对于间接损失或预期利益的损失，可能难以得到支持。
法律程序：
- 在主张赔偿的过程中，用人单位应遵守相关法律程序，如申请劳动仲裁或提起诉讼的时效、管辖等规定。
四、建议
- 预防为主：用人单位应建立健全的规章制度和内部管理机制，加强对员工的培训和管理，预防员工过错行为的发生。
- 及时处理：一旦发现员工存在过错行为并造成损失，用人单位应及时采取措施进行处理，包括与员工协商、申请劳动仲裁或提起诉讼等。
- 寻求专业帮助：在处理此类纠纷时，用人单位可以寻求专业律师的帮助，以确保其权益得到充分保护。
如果您在处理此类纠纷时遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。