针对“版权所有者不起诉，客户起诉怎么处理”的问题，首先我们要明确一点：即使版权所有者选择不起诉，这并不意味着侵权行为就被默许或合法化。版权的合法权益仍然受到法律的保护，且有多种处理方式可以应对此类情况。

以下是对该问题的详细解答：

1. 立即停止侵权行为：

   • 无论版权所有者是否起诉，一旦发现侵权行为，侵权方应立即停止所有侵犯版权的行为。这是最基本的法律要求，也是避免进一步法律纠纷的关键。

2. 处理违法所得与侵权工具：

   • 侵权方因侵权行为所获得的违法所得，以及用于侵权的工具、设备等，可能会被相关部门依法收缴或责令退赔给版权所有者。这是为了维护版权所有者的合法权益，同时也是对侵权行为的惩罚。

3. 民事责任不免除：

   • 即使版权所有者选择不起诉，侵权方仍然需要承担因侵权行为而产生的民事责任。版权所有者有权通过民事诉讼等途径，要求侵权方承担损害赔偿等民事责任。这意味着，侵权方可能需要支付赔偿金、道歉等，以弥补版权所有者的损失。

4. 法律监督与再次侵权的风险：

   • 相关部门会加强对侵权方的监督，确保其不再从事侵权行为。如果侵权方在后续再次实施侵犯版权的行为，将面临更严厉的法律追究。这包括可能的刑事起诉、更高的赔偿金等。

5. 客户起诉的处理：

   • 如果客户因为版权问题对侵权方提起诉讼，侵权方需要积极应对。这包括聘请律师、准备相关证据、参与诉讼程序等。在诉讼过程中，侵权方需要证明自己的行为不构成侵权，或者证明已经采取了必要的措施来停止侵权行为并赔偿损失。

6. 建议与措施：

   • 对于侵权方来说，最明智的选择是主动承认错误，立即停止侵权行为，并与版权所有者进行协商，寻求和解。这可以避免进一步的法律纠纷和损失。
   • 版权所有者也应积极关注自身权益的保护情况，一旦发现侵权行为，应及时采取措施进行维权。
   • 同时，社会各界也应加强对版权的保护意识，共同维护良好的知识产权环境。

综上所述，即使版权所有者选择不起诉，侵权方也需要认真对待侵权行为所带来的法律后果。最好的方式是主动停止侵权、赔偿损失，并与版权所有者进行积极沟通，以避免进一步的法律纠纷。