公司商标侵权，店铺确实需要承担赔偿责任。下面我将从几个方面详细解释这一结论：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国商标法》第六十三条，侵犯商标专用权的赔偿数额，首先按照权利人因被侵权所受到的实际损失确定；实际损失难以确定的，可以按照侵权人因侵权所获得的利益确定；权利人的损失或者侵权人获得的利益难以确定的，参照该商标许可使用费的倍数合理确定。
   • 对恶意侵犯商标专用权，情节严重的，可以在按照上述方法确定数额的一倍以上五倍以下确定赔偿数额。赔偿数额还应当包括权利人为制止侵权行为所支付的合理开支。

2. 赔偿责任的承担：

   • 店铺如果未经商标注册人许可，擅自使用、销售或提供与他人注册商标相同或近似的商品，即构成商标侵权，需要承担赔偿责任。
   • 赔偿数额的确定会综合考虑权利人的实际损失、侵权人的获利情况、商标的许可使用费以及侵权行为的恶意程度和情节等因素。

3. 实际案例：

   • 以某知名商标侵权案为例，一家店铺未经许可销售侵犯该商标的商品，被商标权利人告上法庭。法院最终判决该店铺承担商标侵权赔偿责任，赔偿数额依据权利人的实际损失和侵权人的获利情况综合确定。

4. 特殊情形：

   • 尽管一般情况下商标侵权需要赔偿，但也存在无需赔偿的特殊情形。例如，如果侵权人能够证明自己没有侵权的故意，且在知道侵权行为后及时停止了侵权行为，同时未造成损害后果的，可能不需要承担赔偿责任。然而，这种情况较为罕见，且需要侵权人提供充分的证据来证明。

综上所述，公司商标侵权时，店铺作为侵权行为的实施者之一，确实需要承担赔偿责任。赔偿数额的确定会综合考虑多种因素，并由法院进行裁定。因此，建议店铺在使用商标前进行充分的查询和审查，确保所使用的商标不侵犯他人的合法权益，以避免不必要的法律纠纷和赔偿责任。