针对您提出的小公司商标侵权如何赔偿的问题，这是一个涉及法律判定和具体计算方式的复杂问题。以下是我为您详细梳理的解答：
一、商标侵权赔偿的基本原则
商标侵权赔偿的基本原则是依据《商标法》的规定，按照权利人因被侵权所受到的实际损失、侵权人因侵权所获得的利益、商标许可使用费的倍数或者法定赔偿（在特定情况下由法院判决）的顺序来确定赔偿数额。
二、赔偿数额的具体确定方式
实际损失：
- 权利人因被侵权所受到的实际损失，包括因侵权所造成的商品销售减少量或侵权商品销售量与该注册商标商品的单位利润乘积计算出的损失。
- 还包括权利人为制止侵权行为所支付的合理开支，如律师费、公证费、调查取证费等。
侵权获利：
- 若实际损失难以确定，则按照侵权人因侵权所获得的利益来确定赔偿数额。
- 侵权获利一般根据侵权商品销售量与该商品单位利润乘积计算；若该商品单位利润无法查明，则按照注册商标商品的单位利润计算。
商标许可使用费的倍数：
- 当权利人的损失和侵权人获得的利益都难以确定时，可以参照该商标许可使用费的倍数来合理确定赔偿数额。
法定赔偿：
- 若上述方法均难以确定赔偿数额，则由人民法院根据侵权行为的情节判决给予五百万元以下的赔偿。
- 对于恶意侵犯商标专用权且情节严重的，可以在按照上述方法确定数额的一倍以上五倍以下确定赔偿数额。
三、赔偿数额的法律判定标准
- 法院在判定赔偿数额时，会综合考虑侵权行为的性质、持续时间、后果以及侵权人的主观恶意程度等因素。
- 赔偿数额应当包括权利人为制止侵权行为所支付的合理开支。
四、实际操作建议
收集证据：
- 权利人应尽可能收集与侵权行为相关的证据，如侵权商品的销售记录、广告宣传资料、侵权人的财务状况等。
- 这些证据将有助于确定实际损失或侵权获利，从而为赔偿数额的确定提供依据。
寻求专业帮助：
- 由于商标侵权赔偿涉及复杂的法律问题和计算方式，建议权利人寻求专业律师或知识产权代理机构的帮助。
- 他们可以提供专业的法律意见和计算服务，帮助权利人更好地维护自己的权益。
协商与诉讼：
- 在确定赔偿数额后，权利人可以与侵权人进行协商，尝试达成和解协议。
- 若协商无果，权利人可以向人民法院提起诉讼，要求侵权人承担相应的赔偿责任。
综上所述，小公司商标侵权的赔偿数额确定方式多样且复杂。在实际操作中，建议权利人根据具体情况选择合适的赔偿数额确定方式，并寻求专业帮助以确保自己的权益得到充分维护。