公司发明专利的主要发明人能否合法使用该专利，需分情况讨论：

一、发明人同时是专利权人

若发明人不仅完成了发明创造，还通过合法程序（如个人申请）成为了该专利的专利权人，那么根据《中华人民共和国专利法》的相关规定，发明人作为专利权人，享有独占实施权。这意味着发明人可以合法地使用、制造、销售、进口其专利产品，或者使用其专利方法以及使用、许诺销售、销售、进口依照该专利方法直接获得的产品，而无需获得其他人的许可。

二、发明人非专利权人（职务发明创造）

在多数情况下，尤其是当发明创造是在执行公司任务或主要利用公司物质技术条件完成时，该发明创造被视为职务发明创造。根据法律规定，职务发明创造的专利申请权属于公司，申请被批准后，公司成为专利权人。

1. 发明人的权利：

   • 发明人虽然不拥有专利权，但享有在专利文件中署名的权利。
   • 发明人还有权根据公司制度获得相应的奖励和报酬。

2. 使用专利的限制：

   • 在公司未明确禁止的情况下，发明人可能出于研究、实验等合理目的使用该专利。但这种使用应当是有限的，并且不得损害公司的利益。
   • 若公司明确禁止或内部规定限制了发明人对专利的使用，那么发明人擅自使用该专利可能构成侵权行为。公司有权要求发明人停止使用，并可能追究其法律责任。

三、特殊情况与建议

• 公司许可：如果发明人希望使用公司的专利进行生产经营活动，应当与公司进行协商，并获得公司的明确许可。双方可以签订许可使用合同，明确使用的范围、期限、费用等条款。
• 内部规定：发明人应当仔细阅读并理解公司的内部规定，特别是关于专利使用和管理的部分。如果公司有明确的禁止性规定或限制条件，发明人应当严格遵守。
• 法律后果：未经专利权人许可，擅自使用其专利可能构成侵权行为。侵权人可能需要承担停止侵权、赔偿损失等法律责任。因此，发明人在使用公司专利前应当谨慎评估法律风险。

总结与建议：公司发明专利的主要发明人能否合法使用该专利，取决于发明人是否同时是专利权人以及公司的相关规定。如果发明人希望使用公司的专利进行生产经营活动，建议与公司进行协商并获得明确许可。同时，发明人也应当仔细阅读并理解公司的内部规定，以避免不必要的法律风险。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。