专利许可合同确实可以适用民法典第511条的规定，但需注意，当法律、行政法规对专利许可合同另有特别规定时，应依照其特别规定。

具体来说：

1. 一般适用情况：

   • 民法典第511条主要规定了合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。
   • 在专利许可合同中，如果当事人对于某些条款（如许可范围、使用费、履行地点等）没有约定或约定不明确，且法律、行政法规没有特别规定时，可以参照民法典第511条的规定进行处理。

2. 特别规定优先：

   • 根据民法典第877条的规定，法律、行政法规对技术进出口合同或者专利、专利申请合同另有规定的，依照其规定。
   • 这意味着，如果法律、行政法规对专利许可合同中的某些内容（如许可方式、期限、费用等）有特别规定，那么这些特别规定将优先于民法典第511条的一般规定。

因此，在处理专利许可合同时，应首先检查是否有法律、行政法规的特别规定。如果有，应依照其规定；如果没有，则可以参照民法典第511条的规定进行处理。如果你在这方面有具体的合同问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。