当商标侵权案件中的当事人（尤其是被侵权方）不主动主张权利时，案件的处理方式会因当事人的身份不同而有所差异，以下分情况讨论：
若被侵权方不主张权利
- 法律后果：从法律层面讲，被侵权方有权选择是否主张其商标权。若其选择不主张，法律并不会强制其必须维权。但这可能导致侵权行为持续存在，进一步损害被侵权方的商标权益，甚至可能因长期不维权而削弱商标的显著性或市场影响力。
- 建议行动：尽管被侵权方有权不主张，但作为专业律师，我建议其考虑商标对其业务的重要性及侵权行为可能带来的长期负面影响。若决定维权，可收集侵权证据，如侵权商品的照片、销售记录、广告宣传等，并考虑通过法律途径（如发送律师函、提起民事诉讼等）来维护自身权益。若决定不维权，也应密切关注市场动态，以防侵权行为升级或扩散。
若侵权方不主张（通常指不抗辩或承认侵权）
- 法律后果：在商标侵权诉讼中，若侵权方不提出抗辩或承认侵权，法院可能会根据被侵权方提供的证据，直接认定侵权行为成立，并判决侵权方承担相应的法律责任，如停止侵权、赔偿损失等。
- 建议行动：对于侵权方而言，若确实存在侵权行为，不主张或抗辩可能并非明智之举。我建议侵权方在收到侵权通知或律师函后，及时评估自身行为的合法性，并考虑与被侵权方进行协商，寻求和解或达成许可协议等解决方案。若决定抗辩，则应积极收集证据，准备充分的抗辩理由，以维护自身合法权益。
额外法律背景与建议：
- 商标侵权的认定：商标侵权通常指未经商标注册人许可，在同一种商品或类似商品上使用与其注册商标相同或近似的商标，可能导致消费者混淆的行为。认定侵权需考虑商标的相似性、商品的类似性以及混淆的可能性等因素。
- 赔偿标准的确定：若被侵权方决定维权并提起诉讼，赔偿数额的确定将依据《中华人民共和国商标法》第六十三条的规定，包括按实际损失、侵权获利、商标许可使用费的倍数或法定赔偿等方式进行计算。具体计算公式及考虑因素可参考我之前提供的详细解释。
- 法律程序的遵循：在处理商标侵权案件时，各方应严格遵循法律程序，包括证据的收集与提交、诉讼的提起与答辩、庭审的参与与辩论等。必要时，可寻求专业律师的协助，以确保自身权益得到充分维护。
总结来说，商标侵权案件中当事人不主张权利的处理方式需根据具体情况而定。无论作为被侵权方还是侵权方，都应充分了解自身权利与义务，并考虑通过法律途径来维护自身合法权益。若您有任何关于商标侵权的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。