在招投标活动中，当投标响应文件内容与中标后双方签订的合同内容不一致时，确定以哪个为准需根据具体情况和法律规定来判断。以下是对此问题的全面分析和解答：
基本原则：
- 合同优先原则：合同是双方当事人意思表示一致的结果，具有最高的法律约束力。一旦合同签订，其条款应优先于投标响应文件和招标文件的内容。
- 招标文件主导地位：在评标阶段，评标委员会依据招标文件中规定的评标标准和方法对投标文件进行评审。若投标响应文件与招标文件存在实质性不一致，通常会影响投标的有效性。
不一致情况的处理：
- 实质性内容不一致：
- 定义：实质性内容通常涉及工程范围、建设工期、工程质量、工程造价等关键条款，这些条款直接影响合同的履行和招投标活动的公平性。
- 处理方式：若合同中的实质性内容与投标响应文件不一致，且这种不一致未在合同签订前得到双方明确认可，一般应以投标响应文件（若其严格响应了招标文件）或招标文件为准。这是因为招标文件规定了项目的基本要求和条件，是投标响应文件的基础。若合同条款背离了这些实质性内容，可能被视为无效或需进行澄清、修改。
- 法律依据：根据《中华人民共和国招标投标法》第四十六条，招标人和中标人不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。
- 非实质性内容不一致：
- 定义：非实质性内容通常指合同格式、文字表述、一般性条款等不影响合同主要权利义务和项目基本性质的内容。
- 处理方式：对于非实质性内容的不一致，双方可在协商一致的基础上进行调整。这种调整通常不会影响合同的履行和招投标活动的公平性，因此可以合同约定为准。
特殊情况的处理：
- 合同明确声明：如果合同中明确声明了某些条款以招标文件或投标响应文件为准，那么在这些情况下，应遵循合同中的明确声明。
- 招投标违法违规：若招投标过程存在违法违规行为，如串通投标、行贿谋取中标等，导致合同无效或部分无效，此时既不适用合同条款，也不单纯以投标响应文件或招标文件为准。而是需根据具体违法情形、过错程度及实际履行情况，通过法律途径（如诉讼或仲裁）重新确定双方的权利义务关系。
实践中的处理建议：
- 加强文件管理：招标人应确保招标文件的准确、完整和一致性，建立健全文件管理制度。投标人应仔细核对招标文件的要求，避免在投标响应文件中出现不一致的情况。
- 及时沟通澄清：在发现文件不一致时，招标人应及时发布澄清公告，向所有投标人说明情况并给出明确的处理方法。投标人如发现招标文件中的疑问或不一致之处，应及时向招标人提出质疑，并根据招标人的澄清答复调整投标响应文件。
- 签订合同前审查：在签订合同前，双方应仔细审查所有相关文件，确保合同条款的清晰、准确和一致性。特别是对于实质性内容，应确保与投标响应文件和招标文件保持一致。
示例说明：
假设在某建筑工程项目中，招标文件规定工程质量标准为优质工程，投标响应文件也严格响应了这一要求。然而，在中标后签订的合同中，工程质量标准被降低为合格工程。这种情况下，合同中的工程质量标准条款与投标响应文件和招标文件存在实质性不一致。根据法律规定和上述处理原则，应以投标响应文件（若其严格响应了招标文件）或招标文件中的优质工程标准为准。
总结与建议：
在处理投标响应文件内容与中标后双方签订的合同内容不一致的问题时，应综合考虑合同签订的前后顺序、不一致内容的性质以及法律法规的特殊规定等因素。为确保招投标活动的公平、公正和顺利进行，建议双方在签订合同前仔细审查所有相关文件，并确保合同条款的清晰、准确和一致性。若遇到不一致情况，应及时沟通澄清并依法依规处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。