结论：员工入职时已超过法定退休年龄3年，两年后被辞退是否需要赔偿，需根据具体情况判断，主要看双方是否构成劳动关系以及辞退的具体原因。

分析：

1. 劳动关系认定：

   • 根据相关法律法规，劳动者达到法定退休年龄后，原则上不再建立劳动关系，而是建立劳务关系。但存在例外情况，如劳动者虽达到退休年龄但未享受养老保险待遇或领取退休金，且用人单位继续用工的，双方可能仍被认定为劳动关系。
   • 在本案例中，员工入职时已超过法定退休年龄3年，若其未享受养老保险待遇或领取退休金，且用人单位继续用工，双方可能构成劳动关系。若已享受相关待遇，则更可能被认定为劳务关系。

2. 辞退赔偿情况：

   • 若构成劳动关系：
     • 用人单位辞退员工需符合法定情形，如严重违反规章制度、不能胜任工作等，并需提前通知或支付经济补偿金。若违法辞退，员工有权要求赔偿金。
     • 经济补偿金计算：根据员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。赔偿金则是经济补偿金的两倍。
   • 若构成劳务关系：
     • 劳务关系不受劳动法调整，双方权利义务主要依据合同约定。若合同未约定辞退赔偿，则员工可能无法获得赔偿。
     • 但若用人单位无故辞退员工，且给员工造成损失的，员工有权要求用人单位承担赔偿责任。

3. 具体建议：

   • 对于员工：
     • 收集证据：如工作证、工资条、考勤记录等，以证明与用人单位存在劳动关系或劳务关系。
     • 咨询律师：根据具体情况，咨询专业律师以了解自身权益和可能的赔偿途径。
   • 对于用人单位：
     • 完善合同：与员工签订明确的劳务合同或劳动合同，明确双方权利义务。
     • 合法辞退：若需辞退员工，应确保符合法定情形，并提前通知或支付相应补偿。

举例：

• 假设员工入职时已超过法定退休年龄3年，且未享受养老保险待遇，用人单位继续用工并签订了劳动合同。两年后，用人单位无故辞退员工。此时，员工有权要求用人单位支付违法辞退的赔偿金，赔偿金数额为员工两个月工资（假设员工工作年限为两年）。
• 假设员工入职时已超过法定退休年龄3年，且已享受养老保险待遇，用人单位与员工签订了劳务合同。两年后，用人单位因员工不能胜任工作而辞退。此时，若劳务合同未约定辞退赔偿，则员工可能无法获得赔偿。

进一步思考：

• 在实际操作中，劳动关系与劳务关系的认定可能因地区、具体案情等因素而有所不同。因此，在处理此类纠纷时，应充分考虑各种因素，并咨询专业律师以获取准确建议。
• 用人单位在辞退员工时，应严格遵守法律法规和合同约定，以避免不必要的法律纠纷和赔偿风险。

如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。