公司若出于非法目的设置两套账是违法的，反之，若基于合法、合理的管理需求设置，则不构成违法。以下是对此问题的详细分析：
一、违法情况分析
法律依据：
- 根据《中华人民共和国公司法》第一百七十一条，公司除法定的会计账簿外，不得另立会计账簿。这是判断公司设置两套账是否违法的核心法律依据。
- 《中华人民共和国会计法》也明确规定，各单位必须根据实际发生的经济业务事项进行会计核算，不得做假账。设置两套账若涉及虚假记载或隐瞒真实情况，将违反会计核算的真实性原则。
法律后果：
- 若公司通过两套账隐瞒收入、虚增成本以逃避税款，将严重违反《中华人民共和国税收征收管理法》，构成偷税行为。税务机关将追缴税款、滞纳金，并处以高额罚款；情节严重时，还可能追究刑事责任。
- 如公司通过两套账进行财务造假，情节严重的可能构成犯罪，如妨害清算罪、虚假破产罪等，直接负责的主管人员和其他直接责任人员将面临有期徒刑、拘役及罚金等刑罚。
实际案例：
- 在实践中，已有不少公司因设置两套账而被税务机关查处，面临严重的法律后果。这些案例通常涉及隐瞒收入、虚增成本等违法行为，严重扰乱了市场秩序和税收管理。
二、合法情况分析
合法依据：
- 企业出于管理需要，可能在同一会计主体内编制多套辅助账套，用于内部管理、决策支持等。只要这些账套的核算基础真实、未违反法律法规，且建账目的合法，则不构成违法。
实际操作：
- 在实际操作中，企业可以设置多套账套以满足不同的管理需求，如成本核算账套、项目管理账套等。但这些账套必须基于真实的经济业务事项进行核算，且不得用于非法目的。
监管要求：
- 即使企业出于合法目的设置多套账套，也应接受相关监管部门的监督。企业应确保所有会计活动的合规性，并定期向监管部门报送相关财务报告。
三、建议与总结
建议：
- 企业应严格遵守相关法律法规，确保会计信息的真实性和完整性。对于因管理需要而设置的多套账套，应确保其合法性、合规性，并接受相关监管部门的监督。
- 企业应加强内部控制和风险管理，确保所有会计活动都符合法律法规的要求。对于任何涉嫌违法的会计行为，应及时纠正并主动向相关部门报告。
总结：
- 公司设置两套账是否违法，关键在于建账的目的和账套内容的真实性。企业应谨慎处理会计事务，避免涉及违法行为，以免面临严重的法律后果和经济损失。
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