针对您提出的“有限责任公司自然人独资破产债务怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、破产程序与债务清偿的基本原则
在有限责任公司（自然人独资，即一人有限责任公司）破产的情况下，债务的清偿需严格遵循《中华人民共和国企业破产法》及相关法律法规。破产程序主要包括破产申请、受理、财产清算与评估、债权申报与确认、破产财产分配以及企业注销与终结等步骤。债务清偿则遵循法定顺序，确保公平、公正。
二、债务清偿的具体顺序
破产费用和共益债务：这些费用是破产程序顺利进行所必需的，包括破产案件诉讼费用、管理人执行职务费用等，具有优先支付的地位。
职工债权：包括工资、医疗、伤残补助、抚恤费用以及应划入职工个人账户的社保费用等。这些债权关系到职工的切身利益，因此在清偿顺序中占据重要地位。
社会保险费用和税款：除职工债权外的其他社保费用和所欠税款，也是破产财产清偿的重要对象。
普通破产债权：在清偿完上述优先债权后，剩余财产将按比例分配给普通债权人。
三、股东的责任划分
有限责任原则：在一般情况下，股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任。这意味着，如果股东已经足额缴纳了出资，且公司财产与个人财产独立，那么在公司破产时，股东无需用个人财产来偿还公司债务。
连带责任情形：然而，在特定情况下，股东可能需要承担连带责任。这主要包括两种情形：一是股东出资不实或抽逃出资，即股东未足额缴纳出资或抽逃出资，导致公司财产减少，无法清偿债务；二是人格混同，即股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害债权人利益。例如，将公司财产与个人财产混同，随意挪用公司资金用于个人消费等。在这些情况下，股东需对公司债务承担连带责任，即需用个人财产来偿还公司债务。
四、特别注意事项与法律风险
逃废债务与非法转移财产：在破产清算过程中，如果发现公司存在逃废债务、非法转移财产等行为，将依法追究相关人员的法律责任。这不仅包括民事责任，还可能涉及行政责任乃至刑事责任。
信用记录影响：如果公司被认定为恶意逃避债务或存在其他违法行为，不仅会影响公司的信誉，还可能对股东的个人信用记录造成负面影响。这可能导致股东在未来的经济活动中受到限制或歧视。
五、实际建议
确保公司财产与个人财产独立：作为一人有限责任公司的股东，应确保公司财产与个人财产严格分离，避免混同。这有助于在破产时保护个人财产不受公司债务的影响。
及时履行出资义务：股东应按时足额缴纳出资，避免出资不实或抽逃出资的情况发生。这有助于维护公司的资本充足性，降低破产风险。
寻求专业法律帮助：在面临破产或债务问题时，建议寻求专业法律帮助。律师可以提供详细的法律咨询和解决方案，帮助股东更好地应对破产程序和债务清偿问题。
综上所述，有限责任公司自然人独资破产时，债务的清偿需严格遵循法定程序和顺序。股东应了解自身的责任界限和法律风险，并采取相应措施保护个人财产和信用记录。如有需要，建议寻求专业法律帮助以应对复杂情况。