针对您提出的“挂靠公司自主经营怎么办”的问题，我首先要明确指出，挂靠公司经营行为确实存在较高的法律风险，并且在部分行业，如建筑施工、运输等，这种行为是被明确禁止的。因此，我建议您在考虑经营模式时，务必遵循合法合规的原则，以确保企业的长期稳定发展。
一、挂靠公司经营的法律风险剖析
违法性风险：
- 在特定行业，挂靠行为直接违反了法律法规，如建筑施工领域的资质转让、出借等行为。
- 即便在未明确禁止的行业，挂靠也可能因违反公平竞争原则、扰乱市场秩序而面临法律制裁。
责任承担风险：
- 挂靠双方在经营过程中产生的债务、质量问题、安全事故等责任归属往往复杂且难以界定，容易引发纠纷。
- 被挂靠公司可能因挂靠方的行为而承担连带责任，这不仅损害了被挂靠公司的声誉，还可能对其经济利益造成重大损失。
二、合法经营的建议与步骤
深入了解法律法规：
- 在决定经营模式前，务必对商业法规、税法、劳动法以及行业特定规定进行深入研究，确保业务活动完全符合法律要求。
选择合法的经营模式：
- 根据您的业务需求和目标，选择适合的经营模式，如独资企业、合伙企业、有限责任公司等。
- 每种经营模式都有其独特的法律要求和责任分配方式，因此需谨慎选择，并确保所选模式与您的业务需求相匹配。
注册公司并办理相关手续：
- 确定经营模式后，按照工商行政管理部门的要求进行公司注册，包括提交必要的文件、缴纳注册费用等。
- 办理税务登记、银行开户等相关手续，确保您的企业具备合法经营的基础条件。
建立合规的财务管理制度：
- 保持清晰、准确的财务记录对于企业的长期发展至关重要。
- 所有交易都应记录在案，并按时向相关部门报告财务状况，以确保财务透明度和合规性。
遵守劳动法规：
- 与员工签订正式劳动合同，明确双方的权利和义务。
- 确保工资、福利和工作环境符合当地劳动法规要求，以维护员工的合法权益和企业的良好形象。
寻求专业法律咨询：
- 在处理复杂商业事务时，咨询专业律师或法律顾问的意见是非常必要的。
- 他们可以根据您的具体情况提供针对性的法律建议，帮助您规避潜在的法律风险。
三、针对挂靠行为的特别提醒
- 如果您确实需要使用他人的资质进行经营，请务必首先确认该行为在法律上的合法性。
- 尽量避免直接挂靠，可以考虑通过合作、联营等合法方式实现资源共享和优势互补。
- 如果您已经存在挂靠关系，我建议您尽快梳理并调整这种关系，确保您的业务活动完全合法且规范。
综上所述，挂靠公司经营行为存在诸多法律风险，我强烈建议您遵循合法合规的原则进行经营。通过深入了解法律法规、选择合法的经营模式、办理相关手续、建立合规的财务管理制度、遵守劳动法规以及寻求专业法律咨询等措施，您可以有效降低法律风险，保护企业和个人的利益。