老板不能因你欠其父亲款项而扣发你的工资，这是两种不同的法律关系，应分别处理。针对你目前的情况，以下是从不同角度为你提供的详细分析和建议：

一、明确法律关系与责任

1. 欠款关系：你欠老板父亲的钱，这属于私人之间的债权债务关系。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，债务应当清偿。但这并不意味着老板可以因此扣发你的工资。

2. 劳动关系：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这是你作为劳动者的基本权益，老板必须遵守。

二、解决途径与法律步骤

1. 友好协商解决

   • 沟通方式：首先，你可以尝试与老板进行坦诚的沟通，说明你欠其父亲款项的情况，并表示愿意按计划偿还。同时，明确指出工资与欠款是两回事，要求老板依法支付你的工资。
   • 协商内容：在协商过程中，你可以提出一个双方都能接受的还款与工资发放方案，如分期偿还欠款，同时确保工资按时发放。

2. 第三方调解

   • 调解机构：若直接协商未果，你可以向本单位劳动争议调解委员会、基层人民调解组织或行业性、区域性调解组织等申请中立第三方调解。
   • 调解过程：在调解过程中，调解员会听取双方的陈述和意见，提出合理的解决方案，并促使双方达成调解协议。

3. 向劳动监察部门投诉

   • 投诉准备：你需要准备劳动合同、考勤记录、工资条等证据，以证明你与老板之间存在劳动关系以及老板拖欠工资的事实。
   • 投诉流程：向当地劳动监察部门投诉后，劳动监察部门将进行调查，并可能采取措施帮助你追回工资，包括对用人单位进行处罚。

4. 申请劳动仲裁

   • 仲裁时效：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，自你知道或应当知道权利被侵害之日起计算。
   • 仲裁材料：你需要提交仲裁申请书、身份证明、被申请人工商信息、劳动关系证明以及拖欠工资的证据等材料。
   • 仲裁流程：仲裁委员会受理申请后，将安排开庭审理，并作出裁决。裁决具有法律效力，双方需履行。

5. 提起诉讼

   • 诉讼准备：如果对仲裁结果不满或老板拒绝履行仲裁裁决，你可以在收到裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。
   • 诉讼材料：你需要准备起诉状、证据清单、双方身份证明等材料。起诉状需详细说明你的诉讼请求和事实理由。
   • 诉讼流程：法院受理案件后，将安排开庭审理，并作出判决。胜诉后，如果老板仍不支付工资，你可以申请强制执行。

三、额外建议与注意事项

1. 保留证据：在整个处理过程中，务必保留所有相关证据，如沟通记录、劳动合同、工资单、考勤记录等。这些证据将对你维护自身权益起到关键作用。

2. 法律咨询：如果你在处理过程中遇到任何疑问或困难，可以随时向我咨询。我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。

3. 保持冷静与理智：在处理此类纠纷时，保持冷静和理智至关重要。避免与老板发生不必要的冲突和争执，以免加剧矛盾并影响问题的解决。

综上所述，老板不能因你欠其父亲款项而扣发你的工资。你可以通过友好协商、第三方调解、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等途径来维护自己的合法权益。在整个处理过程中，务必保留好相关证据，并随时向我咨询以获取专业的法律建议和帮助。